Examinando por Autor "Castillo Giraldo, Andrés Orlando"
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Publicación Acceso abierto Análisis de la regulación epigenética de la angiogénesis placentaria revela un mecanismo de adecuación homeostática en mujeres con vasodilatación reducida(Universidad de Valle, 2015) Rodríguez Santa, Laura María; Castillo Giraldo, Andrés Orlando; Sanchez Gomez, AdalbertoEl embarazo requiere de una adecuada función endotelial que permita responder fisiológicamente frente a los grandes cambios hemodinámicos que se presentan. La vasodilatación mediada por flujo (VMF) es una técnica no invasiva usada para medir la respuesta vasodilatadora del endotelio en respuesta al estrés por fricción, que en el embarazo se debe, principalmente, al incremento en el flujo sanguíneo de la madre hacia la placenta en formación, dado que en el endotelio se producen factores de crecimiento y moléculas claves para la angiogénesis, este último, un proceso fundamental para el desarrollo vascular de la placenta. Para lo cual, se puso en consideración, un posible vínculo entre el impacto que la función vasodilatadora del endotelio podría generar sobre la angiogénesis de la placenta, trayendo consecuencias a nivel de la regulación de la angiogénesis placentaria en las mujeres que presentaran cambios negativos en la VMF. Para evaluar esta hipótesis, se escogieron mujeres primigestantes, entre los 21 y 27 años de edad, que habían hecho parte de un estudio de seguimiento a lo largo del embarazo hasta el momento del parto. Estas hacían parte del grupo control que no fue complementado con micronutrientes ni sometido a ninguna rutina de ejercicio físico, de las cuales se tomaron muestras de placenta a término, e información de la magnitud de cambio de la variable VMF, que fue establecida mediante la diferencia entre la VMF de la semana 32 menos la VMF de la semana 20 de la gestación (¿VMF). Separando dos grupos de mujeres entre aquellas que presentaron valores altamente positivos (seis mujeres) frente a otras con valores altamente negativos (cinco mujeres) para ¿VMF. Ambos grupos se consideraron embarazos sanos, al no haber reportado ningún tipo de patología durante el período gestacional. Sin embargo, estos cambios podrían estar generando modificaciones a nivel molecular. Para ello, se realizó un análisis transcripcional en estos dos grupos, usando la técnica RNA-seq, a partir de dos muestras de tejido de placenta por grupo; las edades de estas mujeres fueron 21 y 27 años en cada grupo. Los niveles de expresión diferencial fueron caracterizados usando el algoritmo GFOLD para la cuantificación de los transcriptos. Adicionalmente, se evaluaron mecanismos epigenéticos en las mismas muestras de placenta, como la metilación del ADN, en regiones promotoras de genes involucrados en la angiogénesis, y miRNAs en seis muestras del grupo ¿VMF positivo y cinco del grupo ¿VMF negativo (en ambos grupos las edades de las madres fueron homogéneas), con funciones regulatorias sobre la angiogénesis. En ambos casos se utilizaron arreglos de PCR como metodología de detección y cuantificación. Con base en estos resultados se propone un mecanismo de adecuación homeostático, mediante el cual, vías de señalización pro-angiogénica pueden ser activadas en búsqueda de atenuar las señales anti- angiogénicas disparadas por una reducida vasodilatación. Sin embargo, cabe resaltar, que el efecto en la dinámica celular al verse sometida a estos cambios podría marcar tanto a las madres como a sus futuros hijos a la predisposición a desarrollar enfermedades vasculares como la diabetes en la etapa adulta, para los niños, y en unos próximos años para las madresPublicación Acceso abierto Caracterización molecular de las variantes del virus Epstein-Barr detectadas en cavidad oral de adolescentes colombianos(Universidad del Valle, 2019) Arturo Terranova, Daniela; Castillo Giraldo, Andrés OrlandoEl virus de Epstein-Barr (VEB) es un virus ubicuo y oncogénico, asociado con el desarrollo de enfermedades como la mononucleosis infecciosa, el linfoma de Burkitt, el carcinoma nasofaríngeo y otras neoplasias. Actualmente, se reconocen dos subtipos: VEB-1 y VEB- 2, distinguidos según las diferencias genéticas de sus antígenos nucleares EBNA. Así mismo, debido al alto grado de heterogeneidad y variabilidad encontrado en la proteína LMP1 del virus, se han descrito variantes asociadas a patogenias o a regiones geográficas específicas. Con el objetivo de identificar y caracterizar molecularmente las variantes del VEB detectadas en la cavidad oral de 100 adolescentes de la ciudad de Cali, Colombia, se realizó la amplificación por PCR convencional del gen EBNA3C para tipificar el virus y la amplificación, , purificación y secuenciación del dominio C-Ter de la proteína LMP1 para identificar variantes; se realizó un análisis filogenético y de mutaciones de las secuencias obtenidas comparándolas con variantes patogénicas o geográficas reportadas en GenBank-NCBI. El subtipo viral predominante fue el VEB-1(78 %); además, un 72,6% de aislados agruparon con la variante patogénica Raji, derivada de linfocitos B de un paciente con Linfoma de Burkitt, 13,7% se relacionó con variante de origen geográfico Mediterráneo y otro 13,7% no agrupó con ninguna de las variantes de referencia. Esta es la primera vez que se identifican variantes de LMP1-VEB en Colombia, por lo que estudios adicionales serán necesarios para caracterizar la variante sin identificar, y reconocer si es patogénica o es un aislado geográfico propio, presente en Cali.Publicación Acceso abierto Caracterización molecular del Gen L1 del virus de papiloma bovino entre poblaciones bovinas colombianas(Universidad del Valle, 2016) Gongora Giron, Stephania; Castillo Giraldo, Andrés Orlando; Sedano Cruz, Raul ErnestoEl virus del papiloma bovino es un agente epiteliotrópico infeccioso perteneciente a la familia Papillomaviridae que contiene un genoma circular de ADN de doble hebra. El objetivo del presente estudio fue analizar una secuencia parcial del gen L1 del virus del papiloma en bovinos colombianos. Se recolectaron 16 muestras de lesiones cutáneas obtenidas de bovinos. Amplicones de un fragmento de ADN del gen L1 de VPB se detectaron usando la técnica de la PCR mediante los cebadores MY09/MY11 en 14 muestras. Doce de ellas fueron identificadas por secuenciación directa como BPV-2, y dos como BPV-3. El análisis filogenético permitió dividir los amplicones parciales del gen L1 para el BPV-2 en dos grupos filogenéticos según su origen geográfico, y en un grupo separado las dos muestras para BPV-3. La superficie icosaédrica del virión del papilomavirus está formada por la proteína L1. En el presente estudio se evaluó el efecto del cambio de aminoácidos Leu386Val en la proteína L1 sobre la estabilidad a la cápside viral, la cual mostró una disminución de la energía libre de Gibbs en el ensamblaje de sus capsómeros.Publicación Acceso abierto Citrato sintasa, citocromo C oxidasa y eNOS como biomarcadores de función placentaria en un grupo de primigestantes diagnosticadas con preeclampsia(Universidad del Valle, 2015) Vela Prieto, Cesar José; Aguilar de Plata, Ana Cecilia; Castillo Giraldo, Andrés OrlandoLa preeclampsia (PE) es la mayor causa de restricción del crecimiento intrauterino y mortalidad perinatal. Se ha observado, que su etiología se encuentra relacionada con disfunción endotelial, deficiencia en la vascularización placentaria y alteraciones en la función mitocondrial entre otras. Objetivos: en el presente estudio se compararon los niveles de expresión de la proteína eNOS como biomarcador bioquímico de función endotelial; y las actividades de las enzimas citrato sintasa (CS) y citocromo c oxidasa (COX) como biomarcadores bioquímicos de función mitocondrial, en tejido placentario obtenido de un grupo de mujeres primigestantes diagnosticadas con preeclampsia vs. un grupo control.Publicación Acceso abierto Construcción y caracterización de consorcios microbianos autoensamblados fijadores de N2 y CO2 atmosférico(Universidad del Valle, 2024) Suárez López, Eliana; Sanabria, Janneth; Castillo Giraldo, Andrés OrlandoLa fijación biológica de nitrógeno y dióxido de carbono, así como los mecanismos biológicos subyacentes a estos procesos han sido ampliamente estudiados; sin embargo, la exploración ecológica específica de comunidades bacterianas fuertemente seleccionadas para favorecer ambas capacidades metabólicas y sus posibles aplicaciones biotecnológicas constituye un área de investigación innovadora. La comprensión de la estructura y funcionamiento de estas comunidades puede sentar las bases para futuras aplicaciones, por ejemplo, en el campo de la agricultura, con la fabricación de biofertilizantes nitrogenados. En este estudio, se construyeron consorcios microbianos utilizando muestras de ecosistemas altamente contrastantes (suelo, lodo y materia fecal humana). Estos consorcios se autoensamblaron en un biorreactor alimentado con un medio de cultivo mineral líquido, sin adición de compuestos nitrogenados o fuentes de carbono. El sistema operó con un flujo continuo de aire atmosférico que aportó N2 y CO2 y un recambio semanal del 50% del volumen. Se realizaron mediciones de nitrógeno total, pH, densidad óptica; y análisis de diversidad bacteriana con base en secuenciación de las regiones V3 y V4 del gen 16S ribosomal, para las muestras iniciales y las comunidades autoensambladas. Además, se predijeron las funciones metabólicas para las comunidades utilizando el software PICRUSt2 y se compararon las funciones obtenidas entre las comunidades ensambladas y las iniciales. Los resultados sugieren una asociación y sintrofía entre los miembros de las comunidades como respuesta a las condiciones de selección con un favorecimiento esperado de la fijación de N2 y CO2, metabolismos altamente extendidos entre las bacterias. Entre los géneros más abundantes se encontraron Azospirillum, Gordonia, Burkholderia y Sphingobium.Publicación Acceso abierto Detección del virus del papiloma humano en mujeres residentes de la ciudad de Cali(Universidad de Valle, 2019) Arbeláez Vásquez, Alejandra; Castillo Giraldo, Andrés Orlando; Suárez Ortegón, Miltón FabiánLa presente tesis doctoral brinda un panorama nacional a cerca de la presencia de VPH en diferentes poblaciones femeninas, vacunadas y no vacunadas, con el fin de estimar las tasas de detección y los genotipos circulantes en los diferentes grupos poblacionales. Se exploran rutas de transmisión no sexual del VPH (vertical y horizontal) entre madres e hijos y se aborda de forma exploratoria la efectividad de las iniciativas gubernamentales en pro de la detección y diagnóstico temprano de lesiones pre-cancerosas en la población colombiana; mediante la formulación de diferentes proyectos de investigación, presentados en los capítulos II, III, IV y V del presente documento.Publicación Acceso abierto Diversidad, composición y funcionalidad fúngica de dos manglares que defieren en los usos del suelo(Universidad del Valle, 2020) Rodríguez Vásquez, María Camila; Benítez Campo, Neyla; Castillo Giraldo, Andrés Orlando; Rivera Franco, NelsonEl manglar es un ecosistema intermareal ubicado en las costas tropicales y subtropicales, y tiene una gran importancia a nivel mundial debido a los servicios ecosistémicos que ofrece. El papel que desempeña en el ciclo del carbono es considerado la función más importante, proceso en el que los hongos cumplen un papel fundamental al realizar procesos de degradación de compuestos lignocelulósicos. A pesar de su importancia, en los últimos años se han presentado niveles alarmantes de destrucción de este ecosistema, siendo las perturbaciones antropogénicas las principales causantes de esta pérdida. Con el propósito de conocer la diversidad, composición y función de las comunidades fúngicas de dos manglares del pacifico colombiano que difieren en el uso del suelo, se realizó un análisis bioinformático de datos resultantes de la secuenciación de la región ITS2 del ADN ribosómico, provenientes de seis muestras de sedimento superficial de los manglares de Islalba y Punta Soldado. Los resultados mostraron que en ambos manglares el phylum más abundante fue Ascomycota seguido de Basidiomycota. El análisis funcional mostró que los hongos están llevando a cabo la degradación de compuestos lignocelulósicos en ambos manglares, corroborando su importante rol ecológico en la degradación de estos. En las categorías tróficas los saprótrofos fueron el gremio con mayor abundancia, lo que sugiere un papel relevante de los hongos en el ciclo de la materia orgánica, adicionalmente, se encontró la presencia de patótrofos únicamente en Islalba, lo que podría indicar la influencia de actividades antrópicas.Publicación Acceso abierto Efecto de la minociclina en la expresión de metaloproteasa-9 en ratas con trauma craneoencefálico difuso(Universidad del Valle, 2018) Vergara Arce, Jhonatan Andrés; González Duque, Diana Marcela; Castillo Giraldo, Andrés OrlandoEl Trauma Craneoencefálico (TCE) representa un reto epidemiológico a nivel mundial debido a la elevada tasa de comorbilidades relacionadas con las lesiones a las que conduce. El papel que juegan las metaloproteasas (MMP) en la remodelación de la matriz extracelular es ampliamente conocido, pero hay poca información de su participación en el TCE. Una de las MMP que actua en el proceso de remodelación de la matriz extracelular es la MMP9, la cual se expresa en las diferentes fases del desarrollo del tejido cerebral en humanos, siendo fundamental en los procesos de aprendizaje dependientes del hipocampo. Además, se ha reportado en biomodelos murinos con TCE contuso en la fase aguda, la MMP9 se sobre-expresa y aumenta su actividad, lo cual podría ocasionar daños en el tejido cerebral post TCE. Por lo tanto, MMP9 podría ser un posible blanco farmacológico. En la presente investigación se evaluó la expresión de los ARN mensajeros del MMP9 en el hipocampo de ratas Wistar con TCE difuso de intensidad moderada tratadas con minociclina, en la fase subaguda y crónica de la lesión. En la cuantificación relativa de MMP9 se obtuvo que la expresión del gen disminuyo a los 7 y 14 días con respecto al grupo control, sin embargo, a los 30 días post trauma el efecto fue nulo. Estos resultados sugieren que el fármaco minociclina reduce la expresión expresión de MMP9 en la fase subaguda, lo cual podría ayudara reducirla inflamación y disminuir el daño en el tejido cerebral post TCEPublicación Acceso abierto Factores asociados a la presencia del virus de Epstein Barr (VEB), en cavidad oral de estudiantes entre 14 a 17 años en colegios de secundaria de Cali, 2015-2016(Universidad del Valle, 2018) Guzmán Escobar, Leidy Nataly; Bravo Ocaña, Luis Eduardo; Castillo Giraldo, Andrés OrlandoLa principal ruta de transmisión del virus Epstein Barr (VEB) es vía oral, a través de la saliva, en la cavidad oral el virus infecta y se replica en las células epiteliales adyacentes al anillo de Waldeyer; en donde, seguidamente, infecta los linfocitos B. Aproximadamente el 80% de los casos de mononucleosis aguda infecciosa (MI) ocurre en la adolescencia y es causado por VEB. La MI se caracteriza por cursar con fiebre, garganta irritada y glándulas linfáticas inflamadas. El virus Epstein Barr (VEB) está clasificado como carcinógeno del grupo 1 por la Agencia Internacional para la Investigación del Cáncer (IARC). La infección del EBV se ha relacionado con una amplia variedad de enfermedades, desordenes linfoproliferativos, postransplantes, linfomas de células B y T, carcinoma nasofaríngeo, sarcoma del musculo liso, cáncer gástrico, leucoplasia vellosa oral, linfoma de Burkitt y el linfoma de Hodking. El presente trabajo de investigación pretende determinar la frecuencia de exposición al VEB en cavidad oral y determinar los factores asociados a su presencia en estudiantes de colegios de secundaria en la ciudad de Cali-Colombia.Publicación Acceso abierto Factores relacionados a la frecuencia de detección del virus de papiloma humano (VPH) en cavidad oral de estudiantes entre 14 a 17 años en colegios de secundaria de Cali, 2015-2016(Universidad del Valle, 2018) Fernández Osorio, Adrián David; Bravo Ocaña, Luis Eduardo; Castillo Giraldo, Andrés OrlandoUn porcentaje de las infecciones provocadas por determinados tipos del Virus del Papiloma Humano (VPH) puede persistir y convertirse en cáncer. Este virus es la causa de infección más común del tracto reproductivo. La mayoría de las mujeres y los hombres sexualmente activos contraerán la infección en algún momento de su vida y algunas personas pueden tener infecciones recurrentes. En la última década se han reportado estudios epidemiológicos y moleculares que también proponen la asociación de la infección oral del VPH con el desarrollo de ciertos tipos de cánceres de cabeza y cuello. Han sido reportados factores de riesgo en la literatura como tabaco y comportamiento sexual, comúnmente asociados con la infección oral por VPH. Otros estudios asocian la infección oral por VPH con VIH y su inmunosupresión, el incremento de la edad y el cigarrillo, mientras algunos han examinado la asociación entre higiene oral, salud dental, falta de atención odontológica y diagnóstico de periodontitis con la presencia de VPH en tumores de cabeza y cuello. En la última década la vacuna contra el VPH ha jugado un papel importante en la prevención de la frecuencia de aparición del virus.Publicación Acceso abierto Hábitos y conductas relacionadas con cavidad oral y su asociación con la presencia de dos oncovirus (Virus de Epstein Barr y Virus del papiloma humano) en estudiantes entre 14 y 17 años en colegios de secundaria de Cali, Colombia. Análisis secundario(Universidad de Valle, 2019) Franco Rivas, María Alejandra; Castillo Giraldo, Andrés OrlandoIntroducción: Algunos agentes infecciosos como los virus se consideran como iniciadores de cáncer o con la capacidad de aumentar el riesgo de su desarrollo. Están implicados en un 12% en los cánceres humanos y pueden interrumpir las señales que controlan normalmente el crecimiento y la proliferación celular o incluso producir un estado inflamatorio crónico que puede conducir al desarrollo de la enfermedad. El Virus de Epstein Barr (VEB) y el virus de Papiloma Humano (VPH), son dos oncovirus relacionados con diferentes tipos de cáncer. El VEB se ha observado que se puede transmitir por contacto con saliva y besos y se ha asociado enfermedades tumorales como linfoma de Burkitt y carcinoma nasofaríngeo, más del 90% de la población mundial se infecta con este virus. El VPH se transmite por contacto sexual directo siendo el portador el hombre y las más afectadas las mujeres por ser un factor etiológico de cáncer de cérvix y además asociarse a cáncer de orofaringe y cavidad bucal. Como estos dos oncovirus se relacionan por su afinidad con cavidad oral y para el cáncer se ha sugerido a nivel mundial establecer factores preventivos para disminuir la presencia de diferentes tipos de cáncer o identificar en estadios iniciales para una mejor respuesta al tratamiento y supervivencia. La distribución geográfica, algunos factores del medio ambiente y estilo de vida, como relaciones sexuales tempranas, higiene inadecuada, niveles socioeconómico y educacional bajos, dieta y comportamiento sexual en ambos sexos deberían ser identificables en edades tempranas con fines educativos y preventivos. Objetivo: Establecer los hábitos y conductas relacionadas con cavidad oral y la presencia de dos oncovirus (VEB y VPH) estudiados en una población adolescente de 14-17 años en una institución educativa. Métodos: se realizó un estudio de tipo observacional descriptivo de tipo retrospectivo a partir de una base de datos de un estudio previo de VPH16 y VEB en estudiantes de 14 a 17 donde se incluyeron 1565 participantes, se tomó en cuenta características socio-demográficas, hábitos de higiene y salud oral, comportamiento sexual, consumo de cigarrillo e ingesta de alcohol y toda la población recibió vacuna de VPH con 4 años de anterioridad. Los participantes diligenciaron una encuesta en forma anónima para determinar hábitos y prácticas relacionadas con comportamientos sexuales. Las muestras de los 2 oncovirus se realizó por medio de enjuague bucal y de garganta por 30 segundos y se identificó por medio de PCR convencional y PCR en tiempo real- El análisis de los datos se realizó con la prueba exacta de Fisher. Resultados: Se identificó VEB en 601 adolescentes (38,40%), con una leve mayoría en mujeres n=309 (51.41%) que en hombres n=292 (48.59%). Con respecto al VPH se encontró en n=24(1,53%) más en hombres que en mujeres (n=8/33,33%vs n=16/66,67%). Se presentó una asociación significativa entre VEB y los hábitos orales y/o comportamientos sexuales relacionados con el número de compañeros que se habían dado besos, contacto con lengua, experiencia sexual previa y el uso de preservativo (p< 0.05). Con relación el VPH no se encontró una asociación significativa con las variables de hábitos orales, pero si con la presencia de verrugas. Ninguno se relacionó con los hábitos de higiene oral, consumo de cigarrillo o ingesta de alcohol en los jóvenes. Conclusiones: Se encontró una frecuencia alta de VEB en la población adolescente con una significancia con hábitos orales como besos y experiencia sexual previa. El VEB se relacionó significativamente con el comportamiento como el número de besos. El efecto protector de la vacuna del VPH a pesar de los hábitos relacionados con cavidad oral y prácticas sexuales, fue evidente presentándose en un bajo porcentajePublicación Acceso abierto Polimorfismos en enzimas metabolizadoras detoxificantes y de fármacos en habitantes del departamento Nariño, Colombia.(Universidad del Valle, 2021) Montoya Trujillo, Kelly; Castillo Giraldo, Andrés Orlando; Mejia Ortiz, Lizeth GiovannaEl Cáncer Gástrico es una de las principales causas de mortalidad a nivel mundial. En la región andina del departamento de Nariño, se ha reportado una de las tasas más altas de incidencia y mortalidad de la enfermedad. Factores genéticos, ambientales, así como la infección por la bacteria Helicobacter pylori influyen en el riesgo de padecer esta patología. En 19 exomas de pacientes de Nariño, se llevó a cabo un análisis bioinformático para la identificación de variantes moleculares en genes implicados en: el metabolismo de fármacos inhibidores de la bomba de protones, usados para el tratamiento contra Helicobacter pylori (CYP2C19, CYP3A4 y ABCB1); y en el metabolismo de carcinógenos ambientales (CYP1A1, CYP2E1, GSTP1, GSTT1 y GSTM1). Se reportaron los tipos de metabolizadores rápido (74%), intermedio (21%) y pobre (5%) para CYP2C19. En pacientes con lesiones potencialmente malignas y cáncer gástrico se identificaron variantes con una predicción deletérea en los genes CYP2E1 (rs6413419, rs28969387); GSTP1 (rs45506591, rs1392957952); y GSTT1 (rs2266637). Las variantes rs1695 del gen GSTP1 y el alelo de deleción GSTM1*0, presentaron una mayor frecuencia en estos mismos grupos de pacientes. La variante Arg1233Cys (rs563375387) reportada para el gen ABCB1 presentó un efecto deletéreo muy alto y el cambio generó una pérdida de puentes de hidrógeno en la proteína modelada. En este estudio, se identificaron variantes con una posible implicación en el desarrollo de cáncer gástrico para pacientes de Nariño, así como los tipos de metabolizadores para fármacos como los inhibidores de la bomba de protones.