Examinando por Autor "Wist, Julien"
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Publicación Acceso abierto Análisis de huellas metabólicas en muestras de pacientes enfermos del virus dengue por resonancia magnética nuclear.(2016-11-21) Mena Ramírez, Leidy Vanessa; Wist, JulienEl dengue es una enfermedad viral, transmitida por mosquitos Aedes aegypti, el vector más importante en términos de morbilidad, mortalidad y afectación económica. En Colombia, ésta enfermedad tropical representa un pro-blema prioritario en Salud Pública, manifestando variables signos y síntomas que no son característicos, por lo cual se pueden confundir con patologías dentro de los síndromes febriles, presentando un cuadro clínico indefinido. Mediante la implementación de nuevas herramientas que permitan identificar las perturbaciones de los procesos metabólicos y revelar la variedad de rasgos de la infección, es posible la creación de modelos de diagnóstico en etapas tempranas. El análisis de huellas metabólicas, obtenidas por RMN, con estadística multivariada; PCA y OPLS-DA, revelaron diferencias en muestras de suero y plasma de pacientes infectados con el virus dengue (n = 92), que permitieron distinguir entre la fase aguda y la fase de recuperación. Tres metabolitos fueron identificados; lactato, lípidos y un metabolito no identificado, mediante OPLS-DA (R2x = 0.678 y Q2 = 0.592).Publicación Acceso abierto Autenticación del origen botánico y geográfico del café colombiano por metabolómica basada en RMN(2015-11-20) Arana Rengifo, Victoria Andrea; Wist, JulienEl Café de Colombia es 100% Arábico lavado (Coffea arabica L.). Este, debido a las condiciones ambientales y al sistema de gestión de calidad que han diseñado los productores colombianos, cuenta con una gran reputación a nivel mundial como producto de alta calidad. Se sabe que alrededor de 563.000 familias de cafeteros se han organizado a través de la Federación Nacional de Cafeteros para aplicar normas de calidad para la exportación de café. Para garantizar la autenticidad y origen del Café de Colombia se emplea certificaciones como las de Denominación de Origen, Indicación Geográfica Protegida o Marca de Certificación. Sin embargo, Colombia aún no se vale de plataformas analíticas para demostrar que el producto es realmente colombiano, de calidad y que éste no se encuentra adulterado. En este trabajo se ha desarrollado un método simple, rápido y robusto, haciendo uso de huella metabolómica basada en 1H-RMN, para la clasificación del café verde y tostado, por origen botánico (C. arabica vs No C. arabica) y geográfico (café Colombiano vs cafés de otros orígenes). Los modelos que se obtuvieron por PLS-DA, evaluados mediante doble validación cruzada, permitieron predicciones muy precisas (Q2 > 0.74 para la validación interna y Q2 > 0.86 para la validación externa). Estos modelos para el caso de café tostado fueron construidos y evaluados exclusivamente con muestras preparadas de manera estandarizada, con grado de tostado medio a 200 ºC. Debido a que la composición química del café depende del tiempo y temperatura usada durante el proceso de tostado, en este trabajo también se evalúa el efecto del proceso de tostado sobre la predicción de los modelos. Para ello se usaron, en la validación externa, muestras preparadas con cuatro diferentes grados de tostado, medio, oscuro medio, oscuro y muy oscuro, y dos temperaturas, 180 y 200 ºC. En el caso de las muestras con grado de tostado muy oscuro, se observó que el perfil metabolómico es modificado drásticamente, y los valores de predicción obtenidos fueron muy bajos (Q2 < 0.20). Para los demás grados de tostado, se pueden realizar predicciones cercanas a las obtenidas (Q2 > 0.75), si se elimina de la matriz de datos una parte del área de la región alifática del espectro. De acuerdo a estos resultados, las muestras con grado de tostado muy oscuro fueron detectadas y excluidas del análisis de clasificación, obteniéndose de esta manera un modelo robusto que permite predecir muestras de café tostado con tres grados de tostado diferentes, sin necesidad de modificar el conjunto de muestras usado para la construcción de los modelos. Colombia exporta, casi en su totalidad, el café que produce por el gran valor con que éste cuenta en el mercado internacional, por consiguiente, necesita importar café de menor calidad para abastecer el consumo interno del país. Esto facilita la ocurrencia de eventos de adulteración del café Colombiano por parte de los caficultores. Por ello, se incluyeron en el estudio muestras de café de países vecinos (Brasil y Perú) y se compararon los resultados de clasificación de estas muestras con respecto a las de Café de Colombia empleando tanto los estudios de metabolomica 1H-RMN mencionados, como otras técnicas analíticas tales como GC-MS y GC-CIRMS. Los mejores resultados se obtuvieron con RMN seguido de GC-MS. La metodología GC-C-IRMS no permitió una correcta clasificación.Publicación Acceso abierto Determinación de coeficientes de difusión en sustancias puras mediante resonancia magnética nuclear(Universidad del Valle, 2022) Guastar Valencia, Lorraine; Wist, Julien; Pantoja, Christian FelipeLa siguiente propuesta de investigación, plantea el uso de una metodología general que evalúa los diferentes factores que influyen en la medición y en los resultados de coeficientes de difusión obtenidos mediante resonancia magnética nuclear. Se realiza una evaluación de diferentes metodologías para la calibración de gradientes de campo magnético, también, se estudian los efectos ocasionados por la radiación amortiguada y se realiza la atenuación de estos mismos mediante un conjunto de estrategias experimentales, adicionalmente, se propone la implementación de la secuencia de pulsos 13C-RMN para evidenciar nula contribución de dicho efecto. Finalmente se realiza un análisis del efecto de convección y se busca una compensación efectiva usando diferentes herramientas y realizando comparación de estas con la secuencia de pulsos ya establecida DBPPLED. Para comprobar la efectividad se presenta el análisis y comparación de cada uno de los factores tratados en las diferentes secuencias de pulsos comparando los resultados con los datos reportados en la literatura obteniendo resultados completamente satisfactorios.Publicación Acceso abierto Difusión cooperativa en el estudio de mezclas por resonancia magnética nuclear [recurso electrónico](2019-07-03) Pantoja Rivillas, Crhistian Felipe; Wist, JulienEl estudio de mezclas multicomponente es un tema atractivo en la actualidad dado su amplio espectro de aplicaciones y los múltiples enfoques destinados a su caracterización. Desde la óptica de la resonancia magnéticanuclear (RMN) multitud de esfuerzos se suman a la búsqueda de nuevos métodos capaces de acceder a la información contenida en estas. Destacamos entre estos aquellos experimentos que hacen uso del fenómeno de autodifusión (¿movimiento de moléculas individuales en una mezcla en ausencia de gradientes de gradientes de concentración) de los componentes como propiedad física clave en la discriminación entre las diferentes especies presentes en una mezcla. Sin embargo aunque la autodifusión es un tema importante en RMN pocos estudios en el área han concentrado su atención en el desarrollo de experimentos capaces de introducir y analizar fenómenos de transporte mediados por la existencia de gradientes de concentración netos. Este tipo de difusión apodada cooperativa o interdifusión es la motivación fundamental del presente trabajo.Publicación Acceso abierto Nueva aproximación en la simulación computarizada de 1H RMN -1D(Universidad de Valle, 2018) Potes Echeverri, David; Wist, JulienSe estudió la evolución de un sistema de dos espines en Resonancia Magnética Nuclear (RMN) 1H-1D teniendo como objetivo el análisis del acople escalar fuerte empleando la aproximación de Trotter-Suzuki (TS). Se examinó el desempeño de la aproximación comparando los espectros obtenidos con ella y los espectros 1H RMN-1D exactos, por otra parte se hizo uso de las normas matriciales para medir la distancia entre la aproximación y el sistema 1H RMN-1D exacto. Algunos de los resultados de la aproximación mostró resultados muy similares a la aproximación de acople débil, y se contempló la posibilidad de mejoría para los sistemas de espín acoplados fuertemente.