Examinando por Materia "Filogenia"

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    Análisis cladístico de los grupos de especies del género Lachesilla westwood (Psocodea: psocomorpha: lachesillidae)
    (Universidad del Valle, 2016) Saenz Manchola, Oscar Fernándo; Gonzalez Obando, Ranulfo; García Aldrete, Alfonso Neri
    Lachesilla es el género más grande de la familia Lachesillidae, cuenta con alrededor de 310 especies descritas, agrupadas fenéticamente en 20 grupos de especies. Con el objetivo de establecer las relaciones entre esos grupos, se realizó un análisis filogenético con 51 especies y 70 caracteres morfológicos, explorando las topologías más parsimoniosas bajo análisis de peso iguales (EW) e implícitos (IW). Como resultado de ambos análisis, el género Lachesilla no se recuperó como monofilético, dividiéndose en dos grandes clados; el clado A conformado por el grupo de especies Pedicularia + Nadleria, y el clado B conformado por los restantes 19 grupos de especies. El análisis de pesos implícitos (IW) logró una topología más corta y con mejor resolución, permitiendo establecer dentro del clado B, tres subclados con bajos valores de soporte de ramas. El subclado BI lo conformaron las especies de los grupos Rufa + Corona; el subclado BII incluye las especies de los grupos Riegeli + Patzunensis + Forcepeta, mientras que el subclado BIII está conformado por los grupos Andra + Cerorma + Mexica + Centralis + Sclera + Simojovelensis + Texcocana + Fuscipalpis + Q + Szirackii.
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    Caracterización molecular del Gen L1 del virus de papiloma bovino entre poblaciones bovinas colombianas
    (Universidad del Valle, 2016) Gongora Giron, Stephania; Castillo Giraldo, Andrés Orlando; Sedano Cruz, Raul Ernesto
    El virus del papiloma bovino es un agente epiteliotrópico infeccioso perteneciente a la familia Papillomaviridae que contiene un genoma circular de ADN de doble hebra. El objetivo del presente estudio fue analizar una secuencia parcial del gen L1 del virus del papiloma en bovinos colombianos. Se recolectaron 16 muestras de lesiones cutáneas obtenidas de bovinos. Amplicones de un fragmento de ADN del gen L1 de VPB se detectaron usando la técnica de la PCR mediante los cebadores MY09/MY11 en 14 muestras. Doce de ellas fueron identificadas por secuenciación directa como BPV-2, y dos como BPV-3. El análisis filogenético permitió dividir los amplicones parciales del gen L1 para el BPV-2 en dos grupos filogenéticos según su origen geográfico, y en un grupo separado las dos muestras para BPV-3. La superficie icosaédrica del virión del papilomavirus está formada por la proteína L1. En el presente estudio se evaluó el efecto del cambio de aminoácidos Leu386Val en la proteína L1 sobre la estabilidad a la cápside viral, la cual mostró una disminución de la energía libre de Gibbs en el ensamblaje de sus capsómeros.
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    Feminizar é preciso, ou por uma cultura filógina (Dossier Género en Brasil)
    (2011-10-18) Rago, Margareth
    Este texto trae algunas reflexiones sobre el lugar de lo femenino en nuestra cultura, tomando como punto de partida la recurrente estigmatización de la feminista como frustrada, asexuada y mal amada. Cuestiona las reacciones misóginas que la lucha por la emancipación de las mujeres ha provocado al largo de su historia y sugiere alternativamente la posibilidad de la construcción de una cultura filógina.
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    Frecuencias de infección y filogenia de simbiontes bacterianos en poblaciones de Atta cephalotes de Colombia.
    (Universidad del Valle, 2019-04-08) Montoya Lerma, James; Niño, Andrea Cecilia; Armbrecht, Inge; Correa Bueno, Odair; Muñoz Valencia, Vanessa; Valencia Giraldo, Sandra Milena; López Peña, Andrea; Vélez M., Glever Alexander; Mina, Sayra Yadi; Grupo de investigación en Ecología de Agroecosistemas y Hábitats Naturales.
    La hormiga arriera Atta cephalotes es el principal herbívoro del Neotrópico y es considerada un organismo plaga por las pérdidas económicas que genera en sistemas de cultivo y en centros urbanos. Aunque se emplean diversos métodos en su control, la complejidad de esta especie hace que se presenten barreras biológicas y comportamentales, que limitan su efectividad. En Colombia se ha avanzado en el conocimiento de la biología de la hormiga arriera y se han encontrado diferentes microorganismos ectosimbiontes asociados a las hormigas, que aún no han sido caracterizados. Al parecer estos microorganismos establecen relaciones simbióticas que protegen a las hormigas de agentes biológicos con capacidad antagónica o entomopatógena. Sin embargo, no se ha explorado la presencia de otros simbiontes como los endosimbiontes secundarios, algunos de los cuales pueden comportarse como patógenos a nivel reproductivo en diferentes órdenes de insectos. Este estudió contribuyó con la evaluación de la distribución, frecuencias de infección y filogenia de los endosimbiontes Wolbachia, Rickettsia, Spiroplasma, Cardinium y Arsenophonus y de los ectosimbiontes Serratia marcescens y actinobacterias en poblaciones colombianas de A. cephalotes. Los resultados indican que no hay evidencia de asociación entre A. cephalotes y bacterias del grupo actinobacterias. Esto sugiere la presencia de otras bacterias ectosimbiontes en A. cephalotes que pueden funcionar como equivalentes ecológicos a las actinobacterias. En este sentido, la alta frecuencia de infección por Serratia marcescens y su actividad antagónica sobre cepas usadas comercialmente para el control de este insecto plaga soportan esta hipótesis. Además, el ectosimbionte S. marcescens se reportó asociado a las obreras con labores al interior del nido.
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    Leishmania (Viannia) panamensis expresses a nuclease with molecular and biochemical features similar to the Endonuclease G of higher eukaryotes.
    (2011-11-04) Toro Londoño, Miguel A.; Patiño, Edwin Bairon; Robledo, Sara María; Jiménez Ruiz, Antonio; Alzate, Juan Fernando
    Objective: To characterize the molecular and biochemical features of the Endonuclease G of Leishmania (Viannia) panamensis. Methods: The gene of the putative L. (V.) panamensis Endonuclease G was amplified, cloned, and sequenced. The recombinant protein was produced in a heterologous expression system and biochemical assays were run to determine its ion, temperature, and pH preferences. Results: The L. (V.) panamensis rENDOG has biochemical features similar to those found in other trypanosomatids and higher eukaryotes. In addition, phylogenetic analysis revealed a possible evolutionary relationship with metazoan ENDOG. Conclusions: L. (V.) panamensis has a gene that codifies an ENDOG homologous to those of higher organisms. This enzyme can be produced in Escherichia coli and is able to degrade covalently closed circular double-stranded DNA. It has a magnesium preference, can be inhibited by potassium, and is able to function within a wide temperature and pH range. Objetivo: Caracterizar molecular y bioquímicamente la Endonucleasa G (EndoG) de Leishmania (Viannia) panamensis. Métodos: El gen de la putativa Endonucleasa G de L. (V.) panamensis fue amplificado, clonado y secuenciado. La proteína recombinante se produjo en un sistema de expresión heterólogo y la proteína activa se sometió a pruebas bioquímicas para determinar la preferencia de iones, temperatura y pH. Resultados: La rEndoG de L. (V.) panamensis muestra características bioquímicas similares a aquellas descritas en otros trypanosomatidos y en eucariotas superiores. Además, los análisis filogenéticos muestran una posible relación evolutiva con la Endonucleasa G de metazoos. Conclusiones: Leishmania (V.) panamensis posee un gen que codifica para una endonucleasa homóloga a la EndoG de otros organismos superiores, que se puede producir de forma recombinante en Escherichia coli y que es capaz de degradar ADN circular cerrado de doble cadena. Tiene una preferencia por los iones magnesio y manganeso para usarlos como cofactor y es inhibida por el potasio. Además, funciona en un amplio rango de pH y temperatura.
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    Patrones de diversificación morfológica y funcional de peces marinos, expuestos a condiciones ambientales contrastantes. Pacífico oriental versus Caribe.
    (2019-10-31) Tavera Vargas, Jose Julian; Wainwright, Peter
    El levantamiento del istmo de Panamá fue un prolongado y complejo proceso geológico ocurrido durante los últimos 15 millones de años (Ma), que dejó consecuencias evidentes en la circulación global, patrones climáticos, biogeografía, ecología y evolución tanto de la fauna terrestre como de la marina (Stehli & Webb, 1985). La notable similitud morfológica hallada en un elevado número de pares de especies de peces, una a cada lado del continente americano, llevó a (Jordan, 1908), a enlistarlas e hipótetizar acerca de la estrecha afinidad existente entre ellas. Dos ideas principales extraídas del trabajo de Jordan constituyen la base para la hipótesis de esta propuesta. 1) El ancestro común de las especies separadas por el istmo vivía esencialmente bajo las mismas condiciones desde finales del Mioceno hasta el levantamiento total de esta barrera. 2)“una vez separadas las especies estas se modifican en una dirección continua inducida por la selección en el medio ambiente local”. En esta frase Jordán reconoce que las condiciones ambientales pueden dirigir el cambio morfológico. Por lo tanto, el objetivo general de este trabajo radica en comparar la tasa de evolución morfológica de algunos pares de especies hermanas pertenecientes a diferentes familias de peces, con distintas historias de vida y que habitan a cada lado del istmo de Panamá. Para esto se debe reconstruir la historia evolutiva de algunas familias de peces marinos que se pudieron haber diversificado y especiado debido al levantamiento del istmo de Panamá. Identificar los pares de especies hermanas transístmicos y no transístmicos además de las poblaciones de especies circumtropicales. Calibrar el tiempo de divergencia de todos los eventos de especiación atribuibles al istmo panameño. Calcular la tasa de evolución morfológica usando la geografía (i.e Pacífico oriental versus Caribe) como descriptor, y finalmente determinar si existen patrones de convergencia detectables entre los diferentes taxa de cada lado de la barrera que puedan asociarse con características ambientales.