Examinando por Materia "Microbiana"

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    PublicaciónAcceso abierto
    Descripción del microbioma fecal de las aves columba livia y coragyps atratus de Cali, Colombia
    (Universidad del Valle, 2023) Calderón, Miguel Á; Castillo, Andrés; López-Alvarez, Diana Carolina
    El microbiota gastrointestinal es una de las comunidades más importantes de un organismo y dados los múltiples factores que lo influencian y su posible efecto en la salud pública es clave comprender su composición y los patógenos que pueden estar presentes. Por esto, se determinó la composición del microbioma gastrointestinal de C. livia y C. atratus a partir de muestras fecales recolectadas en Cali, así como de secuencias de C. livia de Países bajos y China, C. atratus de Estados Unidos y G. fulvus de Emiratos Árabes. Se identificaron 943 ASVs en las muestras de Cali y 2415 ASVs en todas las muestras. Para Cali, los phyla más abundantes fueron Proteobacteria (57%) y Firmicutes (42%). En general, para C. livia las familias más abundantes fueron Enterobacteriaceae (51,6%), Enterococcaceae (14,9%) y Clostridiaceae (6,3%), mientras que para C. atratus y G. fulvus fueron Fusobacteriaceae (4,2%), Micrococcaeae (4,1%), Peptostreptococcaceae (11,7%) y Moraxellaceae (3,1%). En las muestras de Cali se detectó la presencia de microorganismos con potencial patogénico pertenecientes a los géneros Streptococcus, Campylobacter, Chlamydia y Atopobium en C. livia y Clostridium, Klebsiella, Helicobacter y Fusobacterium en C. atratus. Las muestras de C. livia y C. atratus de Cali difirieron parcialmente en su composición con las muestras de los demás países, posiblemente por la ubicación geográfica, dieta u otros factores. Existen diferencias en la composición taxonómica de especies que comparten una ubicación, pero también entre organismos de una misma especie o nicho que habitan lugares distintos.
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    PublicaciónAcceso abierto
    Microbioma y polifagia en fitófagos : caracterización de los genomas de la comunidad microbiana asociada a larvas de anastrepha obliqua macquart (diptera: tephritidae: tephritinae)
    (Universidad del Valle, 2022) Cárdenas Hernández, Valentina; Velasco-Cuervo, Sandra Marcela; Toro-Perea, Nelson
    La interacción entre insectos fitófagos y microorganismos es una estrategia que permite a los primeros aprovechar el tejido vegetal como recurso alimenticio, a pesar de ser éste nutricionalmente deficiente y abundante en metabolitos tóxicos. La mosca de la fruta Anastrepha obliqua es una especie polífaga que se alimenta, en su instar larval, de los frutos de plantas de diferentes familias. En Colombia, algunos de sus hospederos son las especies Spondias purpurea (Ciruela), Averrhoa carambola (Carambolo) y Mangifera indica (Mango). En este trabajo se empleó la secuenciación de metagenomas completos (WMS) para caracterizar y comparar la microbiota y el microbioma de las larvas de esta especie, cuando se alimentan de los frutos de ciruela, carambolo o mango. La composición de la microbiota y el microbioma mostró diferencias dependiendo de la planta hospedera infestada. De los grupos dominantes se logró reconstruir el genoma de Acetobacter persici, Gluconobacter sphaericus, Tatumella ptyseos y Weissella confusa, localizando genes asociados con metabolismo de aminoácidos y carbohidratos, importantes para el uso del recurso alimenticio. Nuestros resultados representan un punto de partida para entender el rol de los microorganismos en la fitofagia de A. obliqua, sus implicaciones evolutivas y posibles aplicaciones para el control de este insecto plaga.