Examinando por Materia "Microorganismos"
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Publicación Acceso abierto Adaptación de microorganismos fijadores de nitrógeno de vida libre a diferentes concentraciones de sales de amonio(Universidad del Valle, 2019) Gonzalez Castillo, Mayra Alejandra; Sanabria Gómez, Irma Janeth; Rodríguez González, Claudia LorenaLa Fijación de Nitrógeno es considerada uno de los puntos clave de investigación para la sostenibilidad global en el planeta. Por tanto buscar alternativas sustentables es una prioridad mundial. La adaptación a condiciones de estrés salino puede afectar negativamente las bacterias nativas del suelo y limitar el desarrollo de las plantas y la calidad del suelo. Se realizó la selección y la adaptación de comunidades microbianas fijadoras de Nitrógeno provenientes de suelo y de lodos de tratamientos industriales. En Reactores Secuenciales en Batch (SBR). Un primer reactor se inoculó con lodos obtenidos de un Sistema de Tratamiento de Agua Residual de la industria de las levaduras (RL), el segundo reactor se inoculó con un suelo de vocación agrícola del Valle del Cauca (RS). Ambos reactores se alimentaron con un medio libre de nitrógeno para reactivar el crecimiento de los inóculos. Una vez reactivados los inóculos se sometieron a concentraciones definidas de sales para verificar su resistencia al estrés salino. El reactor RS presentó mayores densidades de BFN (2,8E+06 UFC.mL-1) para la fase de enriquecimiento. Al final de la fase de adaptación el reactor RL presentó densidades de BFN 4,6E+07 UFC.mL-1 y el reactor RS de 4,9E+07 UFC.mL-1. Por lo tanto, los resultados obtenidos en el experimento sugieren este tipo de inóculos como una alternativa para la recuperación de suelos degradados por salinidad.Publicación Acceso abierto “Caracterización de aislamientos del complejo acinetobacter baumannii-calcoaceticus con multirresistencia a los agentes antimicrobianos obtenidos de pacientes de las unidades de cuidados intensivos de un hospital de la ciudad de Cali” [recurso electrónico](2019-09-30) Gómez Naranjo, Romel Fabián; Chavez Vivas, Monica (Director de Tesis o Trabajo de Grado); Castillo Giraldo, Andrés Orlando (Director de Tesis o Trabajo de Grado)La resistencia de los microorganismos a los antibióticos es un importante problema de salud pública que afecta a la mayoría de los países del mundo debido a la presión selectiva que ha ejercido el uso indiscriminado de estos medicamentos.Publicación Acceso abierto Comparación de la eficiencia de remoción de diésel en suelos sometidos a procesos de bioaumentación, bioestimulación y atenuación natural(Universidad del Valle, 2019) Valderrama Chavez, Cesar Andres; Barba Ho, Luz Edith; Benitez Campo, NeylaAnte la contaminación desmedida de los suelos con hidrocarburos y específicamente con diésel, se llevó a cabo un estudio a escala de laboratorio durante un periodo de 100 días, donde se usó un diseño estadístico completamente al azar de un factor y 5 niveles, para evaluar el desarrollo de 5 tratamientos (Control Químico (C), Atenuación Natural (AT), Bioaumentación (BA), Bioestimulación (BS) y Control Microbiano (CM)). Los tratamientos se realizaron por triplicado en recipientes de plástico, los cuales contenían 2kg de suelo arcilloso con una concentración de 20,000ppm de diésel. El análisis inicial del suelo estableció las características más importantes de la matriz donde tendría lugar el proceso de eliminación del combustible adicionado; revelando el valor de parámetros de interés para realizar el biotratamiento de los hidrocarburos, tales como: textura, pH, materia orgánica, conductividad eléctrica, densidad de la población microbial y su disposición de nutrientes (fósforo y nitrógeno). Para evaluar el resultado de los tratamientos se midió el contenido de los Hidrocarburos Totales de Petróleo (HTP) cinco (5) días después de contaminar el suelo y al finalizar el experimento. Además, se realizó el seguimiento semanal del pH, la temperatura y la humedad y mensual de Carbono orgánico y Actividad microbiana. Los tratamientos estudiados revelaron la reducción de la concentración de los HTP en un 41,42% para el tratamiento por Atenuación Natural, 46,49% para el tratamiento por Bioaumentación y del 48,18% para el tratamiento por Bioestimulación. Este último mostró el mejor resultado para la reducción de hidrocarburos con diferencia significativa con el tratamiento de Atenuación Natural, pero sin tener una diferencia muy marcada con el proceso por Bioaumentación.Publicación Acceso abierto Construcción y caracterización de consorcios microbianos autoensamblados fijadores de N2 y CO2 atmosférico(Universidad del Valle, 2024) Suárez López, Eliana; Sanabria, Janneth; Castillo Giraldo, Andrés OrlandoLa fijación biológica de nitrógeno y dióxido de carbono, así como los mecanismos biológicos subyacentes a estos procesos han sido ampliamente estudiados; sin embargo, la exploración ecológica específica de comunidades bacterianas fuertemente seleccionadas para favorecer ambas capacidades metabólicas y sus posibles aplicaciones biotecnológicas constituye un área de investigación innovadora. La comprensión de la estructura y funcionamiento de estas comunidades puede sentar las bases para futuras aplicaciones, por ejemplo, en el campo de la agricultura, con la fabricación de biofertilizantes nitrogenados. En este estudio, se construyeron consorcios microbianos utilizando muestras de ecosistemas altamente contrastantes (suelo, lodo y materia fecal humana). Estos consorcios se autoensamblaron en un biorreactor alimentado con un medio de cultivo mineral líquido, sin adición de compuestos nitrogenados o fuentes de carbono. El sistema operó con un flujo continuo de aire atmosférico que aportó N2 y CO2 y un recambio semanal del 50% del volumen. Se realizaron mediciones de nitrógeno total, pH, densidad óptica; y análisis de diversidad bacteriana con base en secuenciación de las regiones V3 y V4 del gen 16S ribosomal, para las muestras iniciales y las comunidades autoensambladas. Además, se predijeron las funciones metabólicas para las comunidades utilizando el software PICRUSt2 y se compararon las funciones obtenidas entre las comunidades ensambladas y las iniciales. Los resultados sugieren una asociación y sintrofía entre los miembros de las comunidades como respuesta a las condiciones de selección con un favorecimiento esperado de la fijación de N2 y CO2, metabolismos altamente extendidos entre las bacterias. Entre los géneros más abundantes se encontraron Azospirillum, Gordonia, Burkholderia y Sphingobium.Publicación Acceso abierto Domesticación de microorganismos y su impacto a la sociedad en la era genómica.(Universidad del Valle, 2017-06-30) Chacón Vargas, Katherine; Postgrado en Ciencias - Biología. Universidad del ValleLos microorganismos son un modelo poco estudiado, pero han incrementado el interés en entender la arquitectura genética de las adaptaciones y los procesos evolutivos para mejoramiento de especies y su uso en la industria (Gibbons & Rinker 2015; Gibbons et al. 2012). Actualmente las nuevas tecnologías de secuenciación han facilitado indagar más a profundidad los cambios a nivel genómico (Jeffries 2005; He et al. 2014) permitiendo a su vez detectar efectos de domesticación como decaimiento de genoma, poliploidia, arreglos cromosómicos, duplicación de genes, perdida o ganancia de rutas metabólicas y mutaciones benéficas que muestran ventajas en un ambiente artificial (Purugganan & Fuller 2009; Douglas & Klaenhammer 2010; Gallone et al. 2016) que llevan a unos fenotipos específicos como alta producción de etanol en el caso de la bacterias Zymomonas mobilis, Echerichia coli y el hongo Saccharomyces cerevisiae (He et al. 2014; Gallone et al. 2016), o consistencia o sabores específicos como Saccharomyces cerevisiae y varias especies del hongo filamentoso Aspergillus (Gibbons et al. 2012; Gibbons & Rokas 2013; Gallones et al. 2016)Publicación Acceso abierto Efectos de microorganismos entomopatógenos y antagónicos como potenciales agentes de control biológicos de hormiga arriera Atta cephalotes (Hymenoptera: Myrmicinae)(Universidad del Valle, 2014) Valencia, Sandra Milena; Montoya Lerma, JamesAtta cephalotes (L.) (Hymenoptera: Myrmicinae) es la más abundante de las hormigas cortadoras de hojas en Colombia. Sus altas poblaciones, consecuencia del incremento de áreas fragmentadas, ocasionan pérdidas en cultivos de importancia agrícola y forestal. El control con insecticidas químicos, es poco efectivo y sus efectos ambientales muy controvertidos. Como alternativa, se busca promover el control natural. En esta dirección, se evaluó la capacidad antagónica de nueve aislados nativos de hongos y nueve de bacterias sobre L. gongylophorus y Serratia marcescens, simbiontes de esta especie de hormiga. Además, se evaluó la actividad insecticida de los mismos aislados, mediante contacto e ingestión. Aquellos microorganismos que demostraron tener actividad antagónica y/o entomopatógena, fueron enfrentados para establecer el grado de coexistencia.Publicación Acceso abierto Efectos de microorganismos entomopatógenos y antagónicos como potenciales agentes de control biológicos de hormiga arriera Atta cephalotes (Hymenoptera: Myrmicinae) [recurso electrónico](2015-02-18) Valencia, Sandra Milena; Montoya Lerma, James (Director de Tesis o Trabajo de Grado)Atta cephalotes (L.) (Hymenoptera: Myrmicinae) es la más abundante de las hormigas cortadoras de hojas en Colombia. Sus altas poblaciones, consecuencia del incremento de áreas fragmentadas, ocasionan pérdidas en cultivos de importancia agrícola y forestal. El control con insecticidas químicos, es poco efectivo y sus efectos ambientales muy controvertidos. Como alternativa, se busca promover el control natural. En esta dirección, se evaluó la capacidad antagónica de nueve aislados nativos de hongos y nueve de bacterias sobre L. gongylophorus y Serratia marcescens, simbiontes de esta especie de hormiga. Además, se evaluó la actividad insecticida de los mismos aislados, mediante contacto e ingestión. Aquellos microorganismos que demostraron tener actividad antagónica y/o entomopatógena, fueron enfrentados para establecer el grado de coexistencia. Todos los aislamientos se realizaron a partir de los desechos de nidos de hormigas criadas en laboratorio. Los aislados compatibles con Mucor sp., Trichoderma sp., Aspergillus ochraceus, A. flavus, Penicillium sp. Dos morfoespecies de Fusarium, al igual que dos del género Bacillus, afectaron negativamente al hongo simbionte. Mucor sp. Y Trichoderma sp. Fueron los más efectivos con una inhibición del 65,18% y 51,94%, respectivamente. El hongo A. flavus fue el único con un efecto sobre S. marcescens, al afectar su crecimiento y la producción de pigmento. De otro lado, A. flavus, A. ochrceus, Penicillium sp., Fusarium sp., Enterobacter sp., Serratia liquefasciens, Bacillus subtilis, dos morfoespecies más de Bacillus y S. marcescens, tuvieron una actividad insecticida importante, siendo en general, mayor el efecto en las aplicaciones por contacto. A. flavus, A. ochraceus y Penicilluim sp. Mostraron mejor actividad que los entomopatógenos de uso comercial, Beauveria bassiana 12 y Metarhizium anisopliae, en términos de la mortalidad acumulada, TL50 y porcentaje de colonización. Por otra parte, la capacidad de coexistencia fue variable, demostrando que Mucor sp., Trichoderma sp. Y A. flavus tienen baja capacidad de crecer en mezcla con los demás microorganismos, por lo que las condiciones más apropiadas para su formulación deben ser evaluadas. Los resultados indican que estos aislados nativos de hongos y bacterias son promisorios para la elaboración de productos biológicos para el control de la hormiga y se constituyen en línea base para investigaciones futuras.Publicación Acceso abierto Evaluación de tecnologías solares asistidas por catalizadores para la eliminación de microorganismos indicadores en aguas superficiales(2014-10-24) Mora Arismendi, Luis EnriqueLos procesos avanzados de oxidación como alternativa o complemento de los procesos de potabilización del agua y de tratamiento de aguas residuales, se viene explorando desde algunas décadas; no obstante, las aplicaciones de tecnologías solares en condiciones de campo aún tienen muchos aspectos por elucidar para garantizar la inocuidad de sus efluentes. El presente trabajo de investigación, se encamina ahondar en la aplicación de tecnologías solares asistidas por catalizadores (dióxido de titanio y reacciones tipo Fenton), para evaluar su desempeño en la inactivación de microorganismos indicadores de patógenos virales y bacterianosPublicación Acceso abierto La experimentación en la enseñanza de las ciencias para docentes en formación inicial : un caso en microbiología. Una mirada desde la historia de las ciencias.(2015) Morcillo Molina, Carolina; García Arteaga, Edwin GermánEs importante mencionar que este trabajo de investigación está inscrito dentro de grupo de investigación Ciencia, Educación y Diversidad en el marco del proyecto de investigación La Experimentación y los procesos de Formación de Profesores de Ciencias Naturales, que se llevó a cabo junto con la Universidad de Antioquia. Las investigaciones en didáctica de las ciencias muestran la importancia que ha cobrado la incorporación de la historia de las ciencias en la enseñanza de las ciencias, ya que esta es una herramienta que permite conocer de forma más profunda como es creada y validada la ciencia, esto permite hablar y reconocer la importancia de la actividad científica en el proceso de construcción de conocimiento, esto es considerar la riqueza que se esconde en ella. En este trabajo se estudia la forma como es presentada la actividad experimental en los procesos de formación docente, concluyendo que esta actividad se presenta como una simple receta de cocina, con procedimientos metódicos, que promueven una visión empobrecida del trabajo experimental; ante esto García y Estany (2010) sugiere que la manera de presentar los experimentos no debe ser solamente descriptiva o narrativa para reforzar el papel de las teorías, sino que debe avanzar hacia la caracterización de experimentos que involucren problemáticas y que tengan una riqueza conceptual en sí mismos (vida propia) para hacer del experimentador una persona más crítica. Con este trabajo se pretende dar un giro a la forma de hacer práctica experimental es por eso que el eje orientador de esta investigación es: ¿Cuál es la importancia de las prácticas experimentales desde el punto de vista histórico para la enseñanza de la microbiología en la formación inicial de profesores de ciencias?. Ahora bien para dar respuesta a este interrogante se tendrá en cuenta los siguientes aspectos: Reconocer la importancia de la actividad experimental en la enseñanza de la microbiología para docentes en formación inicial de ciencias; Identificar algunos problemas de la actividad experimental en la enseñanza de la microbiología a nivel de docentes en formación inicial; Reconocer aspectos importantes de la actividad experimental desde la historia de la ciencia para la enseñanza de la microbiología; Plantear una propuesta de intervención en las prácticas experimentales para el curso de microbiología para docentes en formación inicial. Bajo estos aspectos la investigación de este trabajo es de carácter cualitativa e interpretativa y para poder cumplir estos propósitos se recurre a la revisión del Manual de Prácticas de Laboratorio de Microbiología para Licenciados en Educación Básica con énfasis en Ciencias Naturales y Educación Ambiental de la Universidad del Valle, como también la revisión de libros históricos originales en los que a través de un estudio de caso se evidencia la riqueza que adquiere la actividad experimental en la construcción de conocimiento, todo esto con el fin de plantear nuevas alternativas en la experimentación y así reorientar la función del experimento en la enseñanza de las ciencias, en este caso la microbiología utilizando como ejemplo el estudio de los microorganismos en los procesos de fermentación.Publicación Acceso abierto Genotipificación Porphyromonas gingivalis - FimA en pacientes con gingivitis y periodontitis en la Ciudad de Cali - Colombia en el año 2011 [recurso electrónico](2015-03-05) Moreno Correa, Sandra Milena; Contreras Rengifo, Adolfo (Director de Tesis o Trabajo de Grado)La periodontitis es una enfermedad inflamatoria que afecta el tejido conectivo de protección, el epitelio sulcular y los tejidos de soporte del diente como son el ligamento periodontal y el hueso alveolar . Uno de los factores desencadenantes de la enfermedad es la persistencia de la biopelícula que se forma sobre las superficies dentales y el margen gingival, que estimula la respuesta inmune del huésped que induce la producción de citoquinas proinflamatorias y enzimas lisosomales por parte de los fagocitos, además de la reducción en la síntesis de colágeno por los fibroblastos y al incremento de la metaloproteinasas del tejido conectivo, las cuales mas allá de su acción protectora pueden conllevar a la destrucción de los tejidos periodontales y activar la resorcion osea, debido a la continuidad del reto microbiano. Diversos microorganismos han sido implicados en la patogénesis de la periodontitis, tales como: Porphyromonas gingivalis, Prevotella intermedia, Tannerella forsythia, Fusobacterium nucleatum, Aggregatibacter actinomycetemcomitans, Micromonas micros, Eikenella corrodens, Treponema denticola, Campylobacter rectus, entre otras especies. Estos microorganismos deben encontrar un nicho ecológico apropiado o sitio de actividad en el huésped para establecerse, crecer y multiplicarse, de tal forma que penetran las barreras físicas tales como el fluido crevicular continuo, la IgA salival, la descamación sulcular epitelial, los polimorfonucleares (PMN), para luego asociarse con las células epiteliales y fibroblastos. Esta asociación o adherencia bacteriana, esencial para la colonización y patogenicidad, la hacen a través de factores de virulencia, los cuales son un conjunto de estructuras o moléculas que ayudan al establecimiento, mantenimiento y protección de las especies bacterianas dentro de los tejidos del huésped.Publicación Acceso abierto Inoculación con microorganismos rizosféricos para restauración de bosque seco tropical: metabarcoding y diversidad(Universidad del Valle, 2022) Castillo Bautista, Mónica Patricia; Armbrecht, Inge; Rugeles Silva, Paula AndreaEl bosque seco tropical (Bs-T) del valle geográfico de río Cauca está reducido a unos pocos relictos rodeados por pastos y cultivos. Los pastos introducidos para forraje ganadero tienen características que afectan las funciones del ecosistema, incluidos los microorganismos. En un proceso de restauración se deben tener en cuenta también los microorganismos del suelo, que a su vez pueden servir como indicadores de la calidad del suelo. Dentro de los microorganismos se encuentran unos catalogados como promotores de crecimiento vegetal. La inoculación de la rizosfera de las plantas con microorganismos puede mejorar el crecimiento y supervivencia de las plantas, técnica que ha sido mayormente estudiada en el mejoramiento de cultivos, más poco se sabe en procesos de restauración de bosque seco de la región. En este estudio se evaluó el efecto de la inoculación con microorganismos rizosféricos de Bs-T sobre el crecimiento de plantas jóvenes de Inga densiflora, y sobre la diversidad de bacterias y hongos promotores del crecimiento asociados en la rizósfera, en el marco de un proceso de restauración ecológica para una zona invadida por pasto guinea, Panicum máximum, y usando la herramienta de metabarcoding, en la evaluación de la diversidad de bacterias y hongos. Después de cinco meses, se encontró mayor diversidad de microorganismos en los suelos de las plantas inoculadas, pero no un efecto estadístico en el crecimiento de éstas. La evidencia sugiere que la inoculación con microorganismos directamente de bosque favorece la diversidad de bacterias y posiblemente de hongos, por lo cual debería ser más estudiada y tenida en cuenta en procesos de restauración ecológica.Publicación Acceso abierto Poblaciones microbianas asociadas a la rizósfera y filósfera de plantas de uchuva (Physalis peruviana L.).(2018-07-18) Toloza Moreno, Deisy Lisseth; Lizarazo Forero, Luz MarinaLas plantas tropicales, entre ellas la uchuva (Physalis peruviana L.) se encuentran asociadas con distintos microorganismos, los cuales llevan a cabo diversos procesos como mejoramiento de la disponibilidad y absorción de nutrientes, descomposición de la materia orgánica, protección frente a fitopatógenos, disminución de los niveles de fertilización química, entre otros. Con este trabajo, se identificaron las comunidades bacterianas y fúngicas asociadas a la rizósfera y filósfera de plantas de uchuva en Ciénega (Boyacá). Se tomaron muestras de raíz, suelo rizosférico y hojas de plantas seleccionadas aleatoriamente. Posteriormente, se hicieron diluciones seriadas para el aislamiento de bacterias asociadas a suelo rizosférico, endófitas y epífitas de raíz y hojas, de levaduras y hongos filamentosos epífitos de la filósfera. La abundancia de bacterias endófitas aisladas fue mayor en los dos nichos, con predominio de las formas bacilares Gram negativas con 54.36% en la rizósfera y 48.32% en la filósfera, siendo Pseudomonas el género más común. En cuanto a la micobiota epífita del filoplano, Rhodotorula spp., fue la especie mayoritariamente identificada con 68.18%. Por lo anterior, se hace necesario conocer la microbiota asociada a los cultivos de uchuva como una primera medida para establecer futuras alternativas de biocontrol contra diferentes fitopatógenos del suelo y foliares.Publicación Acceso abierto Resistencia bacteriana a los antibióticos en la Unidad de Cuidados Intensivos, Hospital de Caldas, 1992-1994.(2014-02-07) Jaramillo V., Eduardo LeónSe describe y analiza el comportamiento de los microorganismos más frecuentes en la Unidad de Cuidados Intensivos (UCI), del Hospital de Caldas (HC), y su sensibilidad/ resistencia a los antibióticos, según los antibiogramas hechos por el laboratorio clínico del HC, entre 1992 y 1994. Enterobacter aerogenes fue el germen más común en la UCI. Staphylococcus dnasa negativo presentó frecuencia creciente, a través de los años del estudio. La UCI aportó 39.6% de Pseudomonas del HC. El germen más frecuente en líquido peritoneal, secreciones traqueobronquiales y orina, fue E. aerogenes; en las puntas de los catéteres venosos, Staphylococcus dnasa negativo; y, en los tubos de tórax, P. aeruginosa. La resistencia a los antibióticos en la UCI fue casi el doble a la de otros servicios del HC. Las cepas de estafilococos meticilino resistentes, en la UCI, superan 60% y empiezan a aparecer cepas resistentes a la vancomicina. Pseudomonas aeruginosa fue muy resistente tanto a los antibióticos tradicionales como a los modernos antipseudomonas. Imipenem fue el antibiótico más eficaz contra Gram negativos aerobios, incluida P. aeruginosa. Incidence of pathogens associated with nosocomial infections at Intensive Care Unite (ICU) of Hospital de Caldas (HC), Manizales, Colombia, and its antibiotic sensitivity and resistance determined by disk diffusion methods between 1992-1994 is described and analysed. E. aerogenes was the most prevalent pathogen at ICU. Dnasa-negative staphylococci are increasing through the years of the study. ICU accounted for 39.6% of the pseudomonas of the HC. The most common pathogen isolated from peritoneal fluid, tracheobronchial secretions and urine was E. aerogenes; from intravascular catheters was dnasa-negative Staphylococcus; and, from chest tubes, P. aeruginosa. Antibiotic resistence at UCI was almost double than that observed at other services of HC. Methicillin-resistant staphylococci were over 60% and some vancomicine- resistant staphylococci were observed at UCI of HC. P. aeruginosa was resistant to both traditional and modern antipseudomonas antibiotics. Imipenem was the most effective antibiotic against Gram negative aerobic, P. aeruginosa included.