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Publicación Acceso abierto Las acciones discursivas en la polémica judicial : estudio del proceso Isaacs 1861-1864. El caso de los muletos. Una aproximación desde la semiótica jurídica(Universidad del Valle, 2016) Tafur Gonzalez, Norman Augusto Javier; Jurado, FabioEn este proyecto de investigación se busca explorar la dinámica enunciativa que ocurre en el proceso judicial; examinar las acciones discursivas mediante las cuales los participantes en el juicio buscan alcanzar sus metas (objeto), tomando para ello (corpus) el juicio de sucesión de don Jorge Enrique Isaacs Adolfus y el subsiguiente concurso necesario de acreedores, tramitado en el juzgado civil del circuito de Palmira entre 1861 y 1864, y específicamente, el llamado Caso de los muletos, demanda presentada por don Braulio José Romero por intermedio de apoderado. Se proyecta analizar los modos de organización del discurso jurídico (al describir, narrar, argumentar), por parte de los sujetos procesales, de acuerdo a los roles y géneros textuales, estrategias, prácticas y formas de vida desde la retórica, las teorías de la argumentación, la narratología y la semiótica discursiva.Publicación Acceso abierto Acople entre un reactor anaerobio de medio suspendido y un reactor anaerobio de crecimiento adherido para la producción de hidrógeno y metano a partir de agua residual del proceso de extracción de almidón de yuca(Universidad del Valle, 2019) Mañunga, Tatiana; Rodriguez Victoria, Jenny Alexandra; Zaiat, MarceloCon relación a la producción de hidrógeno, se evaluó el efecto de cuatro variables sobre el rendimiento de hidrógeno (HY), las variables fueron pH inicial, pretratamiento del inóculo, relación S/X y Carga Orgánica Volumétrica Específica (COVe). Adicionalmente, en este estudio se investigó el uso del efluente de un reactor acidogénico (RA) para la producción de metano con énfasis en el arranque de un reactor metanogénico. Inicialmente, en condiciones de flujo discontinuo fue verificado el efecto del pretratamiento del inóculo y pH inicial sobre el HY. Se evaluaron dos métodos para el pretratamiento del inóculo (térmico -Tco) y químico-Qco), y el pH inicial fue evaluado en tres niveles (5,7, 5,4, y 5,0). Los resultados indicaron que los pretratamientos inhibieron la actividad de bacterias consumidoras de hidrógeno (BCH) durante periodos relativamente cortos (< 100 h). Los mayores HY fueron observados en la combinación Tco5,0 (1,25 ± 0,01 mol H2. mol-1 CH) seguido de la combinación Qco5.4 (1,10 ± 0,02 mol H2.mol-1 CH). La evaluación del efecto del pH inicial sobre el HY mostró que un pH de fermentación entre 5,0 y 5,4 es adecuado para mejorar el HY. Luego, en condiciones de flujo discontinuo se verificó la influencia de la relación S/X sobre el HY a partir de agua residual sintética (S1) y agua residual del proceso de extracción de almidón de yuca (S2). Se seleccionaron tres niveles de la relación S/X (2, 4 y 6 g DQO.g-1 SV). Los resultados indicaron que el HY disminuyó al incrementar la relación S/X con el sustrato S2, en comparación con el control (S1). Para el sustrato S2 el máximo HY de 1,98 mol.mol-1 CHr fue encontrado con la relación S/X 2.0 g DQO.g-1 SV con una tasa de producción específica de hidrógeno de 6,60 mL H2.g-1 SV.h-1. Después, empleando reactores acidogénicos (RA) de crecimiento suspendido fue evaluada la influencia de la COVe sobre el HY. Para tal fin, tres RA fueron inoculados con lodo anaerobio mixto pretratado térmicamente (85°C, 30 min), alimentados con agua residual del proceso de extracción de almidón de yuca y operados en flujo continuo a temperatura ambiente, con tres diferentes COVe (0,8, 1,5 y 3,1 g CH. g-1 SV.d-1) y TRH de 10 h. Aunque esta hipótesis no pudo ser demostrada debido a las posibles interferencias del sustrato sobre las rutas metabólicas, los resultados mostraron una mejor estabilidad del RA operado con una COVe de 0,8 g CH.g-1 SV.d-1, no solo porque permitió un mejor control y cuantificación de la biomasa sino porque fomentó la formación consistente de gránulos productores de hidrógeno (GPH) lo cual resultó de interés para el uso de RA de crecimiento suspendido en la producción biológica de H2 ya que permite el desacople entre el tiempo de retención celular y el TRH. Finalmente, a través del acople entre un RA y un reactor metanogénico (RM) de crecimiento adherido y flujo mixto se investigó el uso del efluente del RA para la producción de metano, simulando un proceso de digestión anaerobia en dos fases, con énfasis en el periodo de arranque del RM. Los resultados mostraron que operar el RA con un TRH de 8 h, COVe de 0,8 g CH.g-1 SV.d-1 y pH de 5,2 ± 0.2 permitió la formación de GPH, lo cual representa un conjunto de condiciones operacionales iniciales para continuar desarrollando la producción biológica de hidrógeno en reactores de crecimiento auto-inmobilizado con control sobre el crecimiento de la biomasa. Sin embargo, se deben adicionar otras estrategias de operación para lograr un HY estable a partir del agua residual del proceso de extracción de almidón de yuca. Por otro lado, se encontró que es factible la producción de metano a partir del efluente acidogénico. Además que un TRH de 28 h y COV de 4,8 g DQO.L-1.d-1 es una condición de operación inicial adecuada para acoplar el RM con el RA. También que el RM soporta cargas orgánicas hasta del orden de 100 g DQO.d-1 siempre que la concentración de DQO y AGV no sea superior a 8.000 mg.L-1 y 2.000 mg A.Acético.L-1.Publicación Acceso abierto Actividad biológica de complejos lantánidos con ligandos N,O-quelato derivados de bencimidazoles(Universidad del Valle, 2022) Aragón Muriel, Alberto; Polo Cerón, DorianLos bencimidazoles se consideran una clase prometedora de compuestos heterocíclicos bioactivos que muestran una amplia variedad de propiedades biológicas útiles debido a sus similitudes estructurales con bases nitrogenadas como las purinas. Cuando estos compuestos presentan grupos aminofenil como sustituyentes en el anillo imidazol, es posible obtener bases de Schiff que resultan adecuadas para mejorar en gran medida el efecto en su actividad biológica y farmacológica. Además de su importancia biológica, estos compuestos forman complejos estables con varios metales de transición, entre ellos, los lantánidos, que también han logrado demostrar un gran número de propiedades biológicas en diferentes estudios. Esta estabilidad aumenta cuando el ligando orgánico presenta más de un punto de coordinación al metal, lo cual es común en compuestos heterocíclicos con sistemas N,N-quelato, N,S-quelato o N,O-quelato. Con el interés de desarrollar nuevos complejos metálicos con potencial actividad biológica, y considerando la posible aplicación terapéutica de complejos lantánidos con ligandos N,Oquelato basados en 2-arilbencimidazoles, esta investigación describe la síntesis y caracterización de complejos lantánidos (La3+, Ce3+, Sm3+) que contienen ligandos tipo aminofenil-bencimidazol y bases de Schiff obtenidas a partir de salicilaldehído y 2,4- dihidroxibenzaldehído. La actividad antiproliferativa de los compuestos fue estudiada sobre células U251 (glioblastoma humano), PC-3 (cáncer de próstata), K562 (leucemia mielógena), HCT-15 (carcinoma colorrectal), MCF-7 (adenocarcinoma epitelial de mama) y células SKLU-1 (carcinoma de pulmón) empleando sulforodamina B (SRB) en un ensayo de microcultivo. La evaluación antibacteriana se realizó frente a las cepas ATCC de S. aureus, L. monocytogenes, P. aeruginosa y E. coli, por el método de microdilución, mientras que la actividad antiparasitaria se llevó a cabo por métodos fluorométricos y MTT frente a P. falciparum, L. braziliensis y T. cruzi. La actividad biológica fue complementada con estudios adicionales de interacción de los compuestos químicos con diferentes objetivos moleculares que incluyen modelos de membrana bacteriana, ADN de timo de ternera, docking molecular con los receptores PBP2A (S. aureus), Cruzaina, Leishmanina y Alfa-tubulina, así como la dinámica molecular para los sistemas de membrana DMPC-DMPG / POPE-POPG, y para la interacción con la superficie de Leishmanina. Los resultados muestran que los complejos lantánidos presentados en este trabajo son generalmente más activos con relación a sus ligandos libres, confirmando un efecto sinérgico, mientras que los estudios de interacción con diferentes objetivos moleculares indican que existe una clara relación estructura-actividad.Publicación Acceso abierto Actividad Catalítica de compuestos de Paladio (II) y Níquel (II) con ligando N-Heterocíclicos [recurso electrónico](2019-09-19) De La Vega Quintero, Gala Paulina; Galarza de Becerra, Esperanza (Director de Tesis o Trabajo de Grado); Cuenu Cabezas, Fernando (Director de Tesis o Trabajo de Grado)La química de coordinación representa un área muy estudiada de las ciencias naturales, sin embargo, la gran variedad de compuestos que pueden obtenerse hace que sigan siendo vigentes las diferentes investigaciones en este campo. Es por ello que en este trabajo se presentan los resultados de la investigación en química de coordinación de ligandos N-heterocíclicos derivados de B-dicetoiminatos, triazoles y bases de Schiff, con los metales de transición Níquel (II) y Paladio (II), adicional a esto se estudió la actividad catalítica de los compuestos de coordinación obtenidos en las reacciones de polimerización de etileno (con Ni) y el acople C-C Mizoroki-Heck (con Pd). Para los complejos de paladio se evaluó también su actividad antifúngica. Los resultados obtenidos demuestran la gran variabilidad de reacciones químicas que se pueden efectuar al comparar elementos que se encuentran en el mismo grupo de la tabla periódica, desde aspectos como la solubilidad hasta la forma de coordinación del ligando al metal, encontrándose en general en este trabajo, que los complejos de paladio son los más robustos, solubles y eficientes como catalizadores, llegando incluso a comportarse como catalizadores verdes ya que son activos en agua. La actividad biológica de algunos de los ligandos y complejos aquí obtenidos también fue estudiada, encontrando que, si bien la actividad biológica no es muy alta, debido entre otros aspectos a la solubilidad de los complejos, se pueden hacer observaciones interesantes respecto a la estructura de los compuestos y su actividad.Publicación Acceso abierto Actividad insecticida de extractos y antioxidante de derivados de ácido cafeico en Tithonia diversifolia, y actividad antibacteriana de los Regioisómeros sintéticos análogos de Achyrofurano en Achyrocline Satureoides(Universidad del Valle, 2018) Pantoja Pulido, Kriss Dayana; Colmenares de Vélez, Ana JuliaEn la presente tesis se describe la actividad biológica de derivados de ácido cinámico en Tithonia diversifolia y regioisómeros análogos de achyrofurano en Achyrocline satureoides. Con el fin de proporcionar un orden secuencial del trabajo de investigación, el documento se estructuró en dos capítulos. En la primera parte del capítulo 1, se describe la evaluación de diferentes extractos de hojas secas de T. diversifolia sobre obreras de colonias de laboratorio de Atta cephalotes mediante ingestión y contacto. Adicionalmente, se analizó la actividad biológica de los extractos como inhibidores de acetilcolinesterasa (AChE) y butirilcolinesterasa (BuChE). El extracto de diclorometano a 1000 ppm, mediante ingestión, presentó la mayor actividad insecticida, al causar 70 y 90% de mortalidad de hormigas obreras en solo cinco y siete días de tratamiento, respectivamente. Los valores de inhibición de la acetilcolinesterasa, mostraron que el extracto de diclorometano tuvo mejor IC50, en comparación a sus fracciones lo que demuestra que la actividad se potencializa al usar el extracto crudo. Estos resultados pueden asociarse a la existencia de terpenos y sesquiterpenlactonas presentes en T. diversifolia probablemente inhibidores de la AChE. En la segunda parte, se reporta el aislamiento de un nuevo derivado de ácido cafeico a partir del extracto butanólico de hojas de Tithonia diversifolia. La estructura se determinó como ácido (E)-3-(((3-(3,4-dihidroxifenil)acriloiloxi)metil)-2-metiloxirano-2-carboxílico (1). Además, se aislaron seis conocidos ácidos fenólicos, ácido 4,5-di-O-dicafeoilquínico (2), ácido 3,4-di-O-dicafeoilquínico (3), ácido 3,5-di-O-dicafeoilquínico (4), ácido 3-O-cafeoilquínico (5), ácido 4-O-cafeoilquínico (6) y ácido 5-O-cafeoilquiníco (7); los compuestos 1, 2 y 3 son reportados por primera vez en esta especie. Las estructuras de los compuestos se establecieron basándose en LC-MS y análisis espectroscópicos de RMN (1D) y (2D). La evaluación de la capacidad antioxidante, realizada en placas de 96 pozos, mostró que los derivados de ácido cafeico probados poseen fuerte capacidad captora de radicales DPPH y moderado poder antioxidante reductor de hierro (FRAP). Finalmente, en el capítulo 2 se describe la obtención de dos dibenzofuranos polioxigenados simétricos análogos de achyrofurano (39a-b) con restos 2-metilbutiroilo en C-4 y C-6 a partir de floroglucinol comercial, a través de una secuencia de reacciones que incluyen monoacilación, yodación, acoplamiento Suzuki-Miyaura, dimerización oxidativa y ciclación. Adicionalmente con esta ruta, se sintetizaron nuevos compuestos racémicos: un derivado de floroglucinol yodado (36), siete derivados de acilfloroglucinol (37a-g) y tres acilfloroglucinoles (38a-b, 46). Algunos de los compuestos obtenidos fueron activos contra bacterias Gram-positivas, incluyendo aislados clínicos multirresistentes de Staphylococcus aureus. El dibenzofurano 39b con cadenas de propilo en C-2 y C-8 exhibió la mejor actividad antibacteriana con valores comparables a los del dibenzofurano achyrofurano natural. Palabras claves: Botón de oro; Hormigas cortadoras de hojas; Actividad insecticida; Actividad inhibitoria de colinesterasa; Derivados de ácido cafeico; 2,2-difenil-1-picrilhidrazilo; Actividad captora de radicales libres; Poder antioxidante reductor de hierro; Contenido total de fenoles; Actividad antibacteriana; Dibenzofuranos; Derivados de floroglucinol.Publicación Acceso abierto Afectividad y mundo : rehabilitación del vínculo entre estados de ánimo y experiencia humana de mundo en Heidegger y Ricoeur(Universidad del Valle, 2024) Escobar García, Henry Jesús; Cuchumbé Holguín, Nelson JairA través de esta tesis doctoral se indaga sobre cómo las consideraciones de Heidegger y Ricoeur sobre los estados de ánimo contribuyen a una rehabilitación del vínculo entre afectividad y experiencia humana de mundo. Al respecto, se afirma que tanto en el planteamiento de Heidegger como en el punto de vista de Ricoeur en lo referido a los estados de ánimo se encuentran elementos conceptuales que hacen posible reconocer la conexión inmanente entre afectividad y experiencia humana de mundo. Toda experiencia humana de construcción de sentido enreda la disposición afectiva que influye en la relación del ser humano con el mundo y la fragilidad que constituye las pasiones de la desmesura del tener, del poder y del valer. Ambos elementos posibilitan comprender el modo como la dimensión afectiva atraviesa todas las producciones de lo humano en las esferas de lo existencial, de lo económico, de lo político y de lo cultural. Para hacer comprensible ese principio de argumentación se organizó una estructura lógica que integra tres capítulos y una conclusión. En el primer capítulo se analiza algunas de las líneas de interpretación suscitadas en el pensamiento filosófico occidental respecto al vínculo entre afectividad y experiencia humana de mundo a partir de la comprensión fenomenológica de Martin Heidegger y Paul Ricoeur. En el segundo capítulo se explica que entender el lugar que ocupan los temples de ánimo en el pensamiento filosófico de Heidegger exige definir de manera comprensible lo afectivo. En el tercer capítulo se muestra en líneas generales algunas de las consideraciones fenomenológicas relacionadas con el modo como Ricoeur entiende la noción de afectividad y el concepto de mundo. Y en la conclusión se plantea que la relevancia de la noción de disposición anímica de Heidegger y del concepto fragilidad afectiva de Ricoeur en relación con la comprensión de la dimensión emotiva permite hablar de la ampliación permanente del horizonte de la acción humana. Se acude a una metodología hermenéutica basada en el análisis de fuentes bibliográficas.Publicación Acceso abierto Agroecological causes of the mass death of peach palm (Bactris gasipaes, Arecaceae) In Colombia(Universidad del Valle, 2021) Vásquez-Ordóñez, Aymer Andrés; Lohr, Bernhard Leo; Montoya-Lerma, JamesLas nuevas interacciones entre cultivos y plagas son una oportunidad para entender el origen y mecanismos de la relación planta-plaga. La reciente e inexplicable muerte masiva de palmas de chontaduro (Bactris gasipaes) en agroecosistemas tropicales colombianos permite explorar las fuerzas ecológicas y evolutivas de la interacción de esta palma y sus picudos barrenadores del tallo. Para esto, los insectos y sus daños fueron examinados en 4098 palmas de chontaduro procedentes de 36 cultivos en las regiones de la Amazonia, Andes y Pacífico en Colombia. La identificación taxonómica de estas plagas requirió una descripción morfológica de las larvas y taxonomía molecular con el gen COI de los géneros Dynamis y Rhynchophorus. De los 419 picudos recolectados en 87 palmas de chontaduro dañadas, 51 fueron D. borassi y 368 R. palmarum. D. borassi fue la plaga inicial al atacar las inflorescencias sin abrir de la palma y barrenar el peciolo hacía el tallo, lo cual facilita el daño posterior de R. palmarum. En 32 de los cultivos se determine el nivel de infestación con un transecto de área variable. Los daños visibles estuvieron entre 0 a 70% de las palmas afectadas y estuvo más alto en la costa pacífica. Se realizaron nuevos reportes en el sur de la costa pacífica, los Andes y la Amazonía. Los niveles de infestación fueron relacionados con 109 variables agroecológicas en todos estos cultivos (ej., tipo de manejo, cobertura de bosque circundante, nutrientes del suelo, clima, etc.). La infestación de los picudos se relacionó con variables de paisaje en las tres regiones, particularmente con la densidad y forma de la cobertura no bosque, el cual es un indicador de la fragmentación del bosque. Los datos soportan la idea que la deforestación y el decrecimiento de recursos (inflorescencias de la palma natural como O. bataua) ocasiona que las poblaciones de D. borassi incremente la infestación de inflorescencias de palmas de chontaduro, la cual inicia el daño y causa finalmente su muerte masiva. Se midieron 17 partes del cuerpo de 23 adultos de D. borassi de palmas de chontaduro (22) y su palma hospedero nativa Oenocarpus bataua (1), y 107 R. palmarum de palmas de chontaduro (43), caña de azúcar (59) y la palma Bismarkia nobilis (5). La caña de azúcar es un nuevo hospedero en Colombia. Los 21 D. borassi de la palma de chontaduro y 59 de R. palmarum de caña de azúcar fueron más pequeños que aquellos de las plantas hospederas nativas. Las secuencias del gen COI de ocho muestras de R. palmarum de caña de azúcar fueron genéticamente diferentes de 149 secuencias (9 de ellas de palmas de chontaduro de este estudio y 138 de Brasil y dos de Costa Rica, procedentes de las bases de datos de GenBank y Bold). Esta investigación genera nuevas preguntas sobre el rol de las especies de palmas hospederas alternativas y su interacción con el paisaje en el origen de una nueva plaga de chontaduro.Publicación Acceso abierto Un algoritmo cuasi Newton inexacto global para problemas de complementariedad no lineal.(2019-09-17) Arias Torres, Carlos Andrés; Martínez Romero, Héctor Jairo; Pérez Mera, RosanaEn este trabajo de investigación proponemos y desarrollamos un método cuasi Newton inexacto global para resolver el problema de complementariedad no lineal (PCNL) de una manera indirecta: en primer lugar, reescribiremos el PCNL como un problema de Complementariedad Horizontal (PCH) y posteriormente, reescribiremos el PCH como un problema de minimización. Cabe destacar que abordar el PCNL de esta manera nos permitirá trabajar con reformulaciones diferenciales de la versión original del problema. De igual forma, proponemos una leve modificación al algoritmo para resolver problemas de complementariedad no lineal, con el fin de obtener un método que permita encontrar las raíces positivas de sistemas de ecuaciones no lineales de gran tamaño.Publicación Acceso abierto Alternativa biotecnológica al proceso fisicoquímico de fijación de nitrógeno a partir de consorcios microbianos(Universidad del Valle, 2023) Rodríguez Arias, Oscar Mauricio; Villegas-Torres, Maria FranciscaEl presente trabajo doctoral aborda alternativa biotecnológica a la problemática asociada al proceso fisicoquímico de fijación de nitrógeno. Se desarrolló una estrategia de bioprospección en donde usando reactores en batch y a partir de inóculos provenientes de suelos y lodos de sistemas de tratamientos de aguas residuales, se establecieron ecosistemas microbianos capaces de crecer sin nitrógeno reactivo. Se determinó que, con la estrategia implementada independientemente del inóculo empleado, se puede establecer un consorcio microbiano fijador de nitrógeno logrando hasta duplicar la concentración de nitrógeno en el medio. Estas comunidades microbianas fueron posteriormente utilizadas en dos procesos biotecnológicos. En el primer caso, se acopló a la producción de metano en la valorización integral de residuos lignocelulósicos con una alta relación carbono nitrógeno C/N, en donde se pudo determinar que adicionando un 10% consorcio microbiano fijador de nitrógeno a un lodo anaerobio con respecto a su concentración de sólidos volátiles, se pudo aumentar hasta en un 57.5% la cantidad de biogas producido empleando bagazo de caña de azúcar (Saccharum officinarum) como sustrato. En el segundo caso, se utilizó un consorcio proveniente de suelo agrícola como sustituto a una fracción comprendida entre el 33% y 66% de la fertilización nitrogenada para la producción de ají cayena (Capsicum annuum L.). Se pudo determinar que al reemplazar en un 33% la fertilización nitrogenada por consorcios microbianos fijadores de nitrógeno se puede aumentar el peso y cantidad de frutos por planta. Los resultados obtenidos en esta investigación pueden ser aplicados en futuros estudios a un modelo integral de biorrefinería en el campo agroindustrial, en donde mediante el aprovechamiento de residuos orgánicos se produzcan biofertilizantes in situ y energía, disminuyendo la huella de carbono y nitrógeno de los procesos.Publicación Acceso abierto An Approach to formal Modeling of grid Computing.(Universidad del Valle, 2016) Ramírez Restrepo, Carlos Alberto; Díaz Frias, Juan Francisco; Aranda Bueno, Jesús AlexanderGrid computing (GC) is a large-scale computational paradigm and infrastructure that comprises a massive poolofresources. Users interact with the gridby concurrently adding new challenging tasksPublicación Acceso abierto An understanding of the prostate cancer pathophysiology for identification of biomarkers that support an early diagnosis(Universidad de Valle, 2018) García-Perdomo, Herney Andrés; Sanchez Gomez, AdalbertoProstate Cancer (CaP) is a condition whose etiology is multifactorial, it goes through genetic, infectious, as well as environmental, among others. Currently, PCa represents the most frequent cancer among men and the second in mortality, however, there are still multiple gaps in the knowledge of this condition. One of them is related to a molecular biomarker that allows early and accurate diagnosis of PCa. We have the Prostate Specific Antigen (PSA), however, its diagnostic performance alone is very low, and it must always be associated with digital rectal examination to obtain the best of both diagnostic methods.Publicación Acceso abierto Análisis comparativo de multifractalidad en genomas humanos colombianos relacionados con poblaciones humanas(Universidad del Valle, 2019) Arias Iragorri, Christian Gustavo; Moreno Tovar, Pedro AntonioEl estudio de las secuencias genéticas y su relación con los diversos fenómenos biológicos presenta una gran relevancia ya que los resultados obtenidos pueden ayudar a la detección y prevención de enfermedades, mejoras en la productividad y resistencia de los cultivos, y un sinnúmero de aplicaciones. Debido a la complejidad y el volumen de datos disponibles además de la gran variedad de tipos de análisis posibles, especialmente en temas de alineamiento y búsqueda de patrones de secuencias, por lo cual, se hace necesario y urgente implementar nuevos abordajes que permitan desarrollar diagnósticos más precisos en los diversos campos y la búsqueda y comprensión de nuevos conocimientos. La mayoría de los algoritmos usados para estos estudios hacen comparaciones que buscan similitudes entre las cadenas que representan el ADN, usando algoritmos como la distancia Levenshtein y Jaro-Winkler, sin embargo, existe otro tipo abordaje donde las cadenas independientes dejan de ser el eje central de las comparaciones y lo que se busca en su lugar, son patrones estructurales, para lo cual se utilizan aproximaciones no lineales. [...] Debido a la complejidad y el volumen de datos disponibles además de la gran variedad de tipos de análisis posibles, se ha fomentado en la investigación el uso de diversos enfoques y técnicas, pasando por áreas tan diversas como técnicas de aprendizaje de máquinas, redes neuronales, modelos de Markov, algoritmos genéticos y fractales (por mencionar algunas), las cuales son potenciadas, gracias a los avances en los sistemas de cómputo, las bases de datos y los algoritmos. Por ejemplo, en la genómica comparada se usa una gran variedad de herramientas para comparar las secuencias de genomas completos de distintas especies, incluido el genoma humano. El propósito de este trabajo en primer lugar, es realizar una comparación entre genes de diferentes organismos, utilizando enfoques no lineales, aplicando conceptos como la ley de Zipf y la dimensión fractal y, en segundo lugar, hacer comparación de genomas completos de poblaciones humanas, incluida una muestra de la población colombiana, utilizando técnicas de análisis multifractal. El contenido de esta Tesis Doctoral inicia con una introducción mencionando la complejidad y necesidad del análisis de secuencias, luego se hacen breves definiciones sobre la genética, así como de sistemas dinámicos, fractales y multifractales, posteriormente se exponen algunos de los estándares en la representación de datos y las bases de datos referencia. Luego se presentan los materiales y métodos utilizados en ambos experimentos para finalmente presentar los resultados y conclusiones de las dos investigaciones efectuadas. El código fuente, el modelo de datos de la base de datos, las instrucciones para acceder a la base de datos y demás material suplementario, se encuentra disponible en el siguiente https://bit.ly/2N0btPHPublicación Acceso abierto Análisis de espacios de formación de ciudadanía en el Valle del Cauca durante las dos primeras décadas del siglo XXI(Universidad del Valle, 2024) Díaz Jordán, Ana María; Sánchez Salcedo, José FernandoEn esta investigación se analizarán algunas de las acciones realizadas por el Estado de manera conjunta con instituciones de cooperación internacional y colectivos de comunicación local, para fortalecer la educación, promoción y ejercicio de la ciudadanía en regiones tradicionalmente marcadas por el conflicto y la economía ilegal. Específicamente, interesa estudiar dos proyectos desarrollados a nivel nacional: ‘Radios Ciudadanas’ (2004-2005 Ministerio de Cultura/PNUD-USAID) y ‘Radios Comunitarias para la paz y la convivencia’ (2017 Resander/ Unión Europea), conociendo el modo como los colectivos de comunicación, de acuerdo a una agenda de temáticas sugeridas por ejecutores y organismos financiadores, justifican la relevancia de hablar sobre la ciudadanía desde lo local, así como también generan entre sus audiencias espacios de participación, debate y discusión de problemas públicos de interés ciudadano. De esta manera, el propósito de la presente investigación reside en comparar, por un lado, la manera en cómo diversos actores elaboran una serie de denuncias, reclamaciones y críticas particulares hasta generalizarlas y configurarlas como asuntos de interés público en relación con el tema de la ciudadanía y, por otro lado, cómo el Estado, con el apoyo de agencias de cooperación internacional, lanza proyectos comunitarios con enfoque en la educación, promoción y ejercicio de la ciudadanía -en el caso particular, que emplean la radio local- para tratar de justificarse ante las denuncias, reclamaciones y críticas y, así, lograr su legitimación en contextos de acción violenta y acuerdos de paz. Para dar respuesta a esta cuestión, se apelará a la sociología pragmática francesa como forma de pensamiento metodológico, en especial, en su aporte a la configuración de los problemas/asuntos públicos y a la sociología de la crítica de Luc Boltanski, la cual supone que cuando un actor responde a una crítica, pone en juego un grupo de argumentos, regímenes de justificación o Citê que están ligados a un juicio práctico de la situación.Publicación Acceso abierto Análisis de la complejidad de los sistemas de producción de cacao (Theobroma) en el Tolima utilizando métodos de inteligencia artificial(Universidad del Valle, 2022) Mora-Herrera, Denys Yohana; Zuñiga Escobar, OrlandoLa incertidumbre, la complementariedad entre elementos y la no linealidad son características de los sistemas de producción de cacao y por tanto se definen como sistemas complejos. Esta investigación se propone modelar un índice de complejidad para los sistemas de producción de cacao utilizando herramientas de inteligencia artificial, específicamente lógica difusa y modelación basada en agentes, para las cuales es indispensable conocer cómo se configuran y cómo se comportan los sistemas de producción a fin de que la modelación y simulación retraten la realidad que en estos ocurre. En campo fueron georreferenciados los lotes del cultivo, se aplicaron encuestas y entrevistas estructuradas para recopilar información socioeconómica y de prácticas de beneficio, asimismo muestras de suelos y de grano seco fueron colectados para posteriormente enviarlos a análisis de laboratorio. Para el modelado de lógica difusa se empleó el software GeoFIS y para la modelación basada en agentes se usó Netlogo, ambas plataformas son de acceso libre. Los datos de 10 fincas se utilizaron para calibrar y ajustar el modelo que posteriormente fue validado con los datos de otras 20 fincas, todas ubicadas en tres municipios del Tolima en Colombia. Los resultados son fáciles de interpretar y consistentes con las observaciones de campo. Además, los resultados fueron validados con los productores de cacao que participaron en la investigación. Dado que las salidas intermedias de los modelos también son interpretables es posible identificar los factores que limitan la variable de salida final así como simular el comportamiento de los sistemas para evaluar estrategias de adaptación propuestas. Estos resultados pueden apoyar procesos de toma de decisiones para mejorar algunos componentes de los sistemas de producción a escala de finca, municipio o país.Publicación Acceso abierto Análisis de la regulación epigenética de la angiogénesis placentaria revela un mecanismo de adecuación homeostática en mujeres con vasodilatación reducida(Universidad de Valle, 2015) Rodríguez Santa, Laura María; Castillo Giraldo, Andrés Orlando; Sanchez Gomez, AdalbertoEl embarazo requiere de una adecuada función endotelial que permita responder fisiológicamente frente a los grandes cambios hemodinámicos que se presentan. La vasodilatación mediada por flujo (VMF) es una técnica no invasiva usada para medir la respuesta vasodilatadora del endotelio en respuesta al estrés por fricción, que en el embarazo se debe, principalmente, al incremento en el flujo sanguíneo de la madre hacia la placenta en formación, dado que en el endotelio se producen factores de crecimiento y moléculas claves para la angiogénesis, este último, un proceso fundamental para el desarrollo vascular de la placenta. Para lo cual, se puso en consideración, un posible vínculo entre el impacto que la función vasodilatadora del endotelio podría generar sobre la angiogénesis de la placenta, trayendo consecuencias a nivel de la regulación de la angiogénesis placentaria en las mujeres que presentaran cambios negativos en la VMF. Para evaluar esta hipótesis, se escogieron mujeres primigestantes, entre los 21 y 27 años de edad, que habían hecho parte de un estudio de seguimiento a lo largo del embarazo hasta el momento del parto. Estas hacían parte del grupo control que no fue complementado con micronutrientes ni sometido a ninguna rutina de ejercicio físico, de las cuales se tomaron muestras de placenta a término, e información de la magnitud de cambio de la variable VMF, que fue establecida mediante la diferencia entre la VMF de la semana 32 menos la VMF de la semana 20 de la gestación (¿VMF). Separando dos grupos de mujeres entre aquellas que presentaron valores altamente positivos (seis mujeres) frente a otras con valores altamente negativos (cinco mujeres) para ¿VMF. Ambos grupos se consideraron embarazos sanos, al no haber reportado ningún tipo de patología durante el período gestacional. Sin embargo, estos cambios podrían estar generando modificaciones a nivel molecular. Para ello, se realizó un análisis transcripcional en estos dos grupos, usando la técnica RNA-seq, a partir de dos muestras de tejido de placenta por grupo; las edades de estas mujeres fueron 21 y 27 años en cada grupo. Los niveles de expresión diferencial fueron caracterizados usando el algoritmo GFOLD para la cuantificación de los transcriptos. Adicionalmente, se evaluaron mecanismos epigenéticos en las mismas muestras de placenta, como la metilación del ADN, en regiones promotoras de genes involucrados en la angiogénesis, y miRNAs en seis muestras del grupo ¿VMF positivo y cinco del grupo ¿VMF negativo (en ambos grupos las edades de las madres fueron homogéneas), con funciones regulatorias sobre la angiogénesis. En ambos casos se utilizaron arreglos de PCR como metodología de detección y cuantificación. Con base en estos resultados se propone un mecanismo de adecuación homeostático, mediante el cual, vías de señalización pro-angiogénica pueden ser activadas en búsqueda de atenuar las señales anti- angiogénicas disparadas por una reducida vasodilatación. Sin embargo, cabe resaltar, que el efecto en la dinámica celular al verse sometida a estos cambios podría marcar tanto a las madres como a sus futuros hijos a la predisposición a desarrollar enfermedades vasculares como la diabetes en la etapa adulta, para los niños, y en unos próximos años para las madresPublicación Acceso abierto Análisis de la variación fenotípica de manchas costales de Anopheles (Nyssorhynchus) en Colombia.(2019-10-15) Cárdenas Henao, Heiber; Muñoz Flórez, Jaime Eduardo (Director de Tesis o Trabajo de Grado); Gonzalez Obando, Ranulfo (Director de Tesis o Trabajo de Grado)Se estudiaron los patrones de manchas costales alares y su variación métrica en poblaciones de siete especies de Anopheles (Nyssorhynchus) de importancia médica en Colombia, usando morfología tradicional. Adicionalmente, se estudió en An. benarrochi B la variación en la conformación y el tamaño del ala utilizando morfología geométrica. Con base en las progenies de hembras recolectadas en campo e isofamilias de especímenes conservados en la colección del Laboratorio de Entomología Médica-Universidad del Valle, se estimaron los componentes VG-CovG y VE de estas características, usando los modelos de Becker (1984), Kempthorne (1969) y Falconer (1989). La asignación de las manchas costales se hizo según Wilkerson y Peyton (1990). Se realizaron comparaciones entre lados del ala, sexos y localidades. Se observó dimorfismo sexual en las frecuencias de los patrones alares y en las longitudes de las manchas costales. Los componentes genéticos de VP: VG, CovG, rG, H2 y Co-H2 fueron altos y significativos en la mayoría de características. Los análisis de morfología geométrica se realizaron siguiendo a Calle et al. (2008). El tamaño y conformación del ala en An. benarrochi B, mostraron alometría residual, asimetría fluctuante, efecto del recipiente de crianza significativas y heredabilidades promedio bajas. Las bajas h2 del tamaño y conformación del ala indican que son mayormente afectadas por el ambiente, con altos niveles de estabilidad en el desarrollo expresado en el porcentaje bajo de los componentes de varianza de asimetría fluctunte y asimetría direccional. Se puede deducir que, posiblemente incluyen interacciones génicas reflejadas en las altas estimaciones de heredabilidad en sentido amplio. En esta investigación se probó la utilidad del modelo Anopheles en estudios de caracteres longitudinales asociados funcionalmente. Se evaluó que tan heredables fueron las manchas costales, la conformación del ala y el tamaño, características utiles en la identificación taxonómica de especies de este género.Publicación Acceso abierto Análisis hidrodinámico del flujo y reducción de la socavación local en muros longitudinales en ríos con lecho granular(Universidad del Valle, 2024) Cely Calixto, Nelson Javier; Galvis-Castaño, AlbertoLa investigación analizó la hidrodinámica del flujo y contramedidas de socavación en muros longitudinales en ríos con lecho granular bien gradado, mediante experimentos físicos en un canal de 9 metros y modelos numéricos en el Flow-3D, se evaluaron pendientes entre 0.5 y 2.5% y caudales entre 0.008 y 0.030 m3 /s. Se encontró que la socavación aumenta hasta un 60% en condiciones máximas de pendiente y caudal. El modelo numérico demostró alta concordancia con los datos experimentales, validando su uso en predicciones a escala aumentada. Se desarrolló una expresión matemática para estimar la socavación local en muros longitudinales en ríos de lecho granular bien gradado y se evaluaron diversas contramedidas. Los mini espigones sumergidos redujeron la socavación en un 58.37%, mientras que la combinación de mantos anti-socavación y técnicas de alteración del flujo logró hasta un 74.42%. Las nervaduras verticales alcanzaron una reducción del 83.94%, y los mantos anti-socavación demostraron un rendimiento del 90.34% al cumplir ciertas relaciones dimensionales en su disposición. El rip-rap fue la técnica más eficaz, con una reducción del 94.03%, aunque su incorrecta disposición puede aumentar la socavación; asimismo, la combinación de blindaje y alteración del flujo es más eficaz que las alternativas de contramedidas de alteración del flujo aisladas. El desarrollo de la encuesta permitió establecer una propuesta de recomendaciones de criterio de diseño de muros longitudinales y contramedidas, aplicables a ríos colombianos, priorizando el blindaje y promoviendo el monitoreo continuo de las obras para mejorar la seguridad y sostenibilidad de las estructuras hidráulicas.Publicación Acceso abierto Análisis molecular in-silico del mecanismo de acción de las enzimas depolimerasas de los bacteriófagos vB_KpnP_BaqKPR2 de K. pneumoniae y vB_SauS_BaqSau1 de S. aureus(Universidad del Valle, 2024) Lozano-Solano, Dayan Surig; Acosta-Hoyos, Antonio JEl presente trabajo tiene como objetivo proponer mecanismos de acción de las enzimas depolimerasas de los bacteriófagos vB_KpnP_BaqKPR2 de K. pneumoniae y vB_SauS_BaqSau1 de S. aureus aislados de aguas residuales de la ciudad de Barranquilla y Sahagún Córdoba, respectivamente, por lo que se consideran fagos autóctonos. Mediante este trabajo se ha podido hacer una aproximación atomística del mecanismo de acción de las depolimerasas de los bacteriófagos BaqSau1 y BaqKPR2, este es el primer estudio que brinda información acerca de la especificidad de los dominios catalíticos de una endolisina nativa hacia otros componentes importantes de la pared bacteriana en S. aureus y de igual forma brinda información importante del rol de las TSP y del dominio depolimerasa sobre la cápsula y otros componentes importantes de la pared bacteriana de K. pneumoniae. Receptores de membrana como la transglicosidasa SaGMT en S. aureus y la osmoporina OMPK36 en K. penumoniae son importantes consideradas dianas terapéuticas. Este trabajo brinda un importante avance sobre el mecanismo de acción de dichas enzimas para ser usados como enzibióticos y para futuras investigaciones que conduzcan a realizar estudios in-vitro para poder confirmar los hallazgos. La comprensión molecular del mecanismo de acción de estas depolimerasas es fundamental aumentando nuestro conocimiento sobre la biología de los bacteriófagos y su posible aplicación en el control de infecciones causadas por K. pneumoniae y S. aureus resistentes a múltiples fármacos representando una estrategia prometedora para combatir estas infecciones.Publicación Acceso abierto Análisis por elementos finitos de la influencia de las variaciones estructurales en el comportamiento biomecánico del disco intervertebral lumbar normal de un trabajador promedio colombiano.(2019-10-15) Gómez Salazar, Lessby; Fierro Pérez, Leonardo; García Alvarez, José JaimeLos trastornos degenerativos del disco intervertebral, son un grave problema de salud pública a nivel nacional e internacional, cuya etiología es reconocida como multicausal. Entre los factores de riesgo asociados a su aparición se mencionan las diferencias anatómicas entre individuos. Sin embargo, aun cuando la literatura reporta variaciones en la estructura del disco intervertebral relacionadas con la forma y tamaño del núcleo pulposo, el número de capas y la orientación de las fibras en el anillo fibroso, su influencia en el comportamiento biomecánico del disco intervertebral en condiciones fisiológicas y laborales en tareas como el transporte de bultos es un tema poco estudiado que se convierte en el objetivo de esta investigación.Publicación Acceso abierto Análisis simétrico de acciones colectivas mediante las que actores heterogéneos agencian la práctica de alimentación Agroecológica(Universidad del Valle, 2018) Tamayo Montoya, Paula Andrea; Molina Valencia, NelsonLa heterogeneidad es fundamental para la construcción de relaciones entre actores y para la realización de acciones colectivas orientadas a fortalecer la práctica de alimentación agroecológica. Mediante la asociación de heterogeneidades se fortalecen las redes y se generar las condiciones para intercambios materiales y simbólicos que generan gratificación (Bertrand, Burel, & Baudry, 2016; Lamine et al., 2017). La heterogeneidad ayuda a mantener el compromiso y vigoriza la convicción de los actores (Chalmers Thomas et al., 2013).