En los procesos para la producción y purificación de productos térmicamente inestables, el diseño juega un papel importante ya que permite determinar los costos y la calidad del producto obtenido. En este trabajo se presenta el modelo de un destilador molecular de película descendente, el cual tiene en cuenta las ecuaciones de balance de calor, materia y cantidad de movimiento para una mezcla multicomponente, aplicado a la concentración del aceite esencial de cidrón (Lippia citrodora). El sistema de ecuaciones diferenciales acopladas resultantes se resolvió mediante el método de Crank-Nicholson. El modelo así obtenido permite simular el proceso de destilación molecular y se utilizó para obtener los perfiles temperatura y concentración en las películas de evaporación y condensación. El aceite esencial se logró concentrar de 47.79% a 89.21% de citral por fondos y de 41.62% a 72.23% de limoneno por destilado.