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Publicación Acceso abierto Análisis de la huella genómica en la mosca de la fruta Anastrepha obliqua asociada con su condición de insecto polífago.(Universidad del Valle, 2021-02-11) Toro Perea, Nelson; Manzano Martínez, María del Rosario; Velasco Cuervo, Sandra Marcela; Aguirre Ramirez, Elkin Julian; Grupo de Investigación en Estudios Ecogenéticos y Biología MolecularAnastrepha obliqua (Macquart) (Diptera: Tephritidae) es una de las principales plagas de impacto económico en el neotrópico ya que sus larvas se alimentan de una gran diversidad de frutos de interés comercial. Se considera un insecto polífago, por lo que infesta plantas de diferentes familias taxonómicas, demostrando que ésta especie puede colonizar y adaptarse a nuevas plantas hospederas. En Colombia, se ha detectado a A. obliqua infestando hospederos nativos como la ciruela y el arazá, y hospederos exóticos como el mango y el carambolo. El cambio a nuevos hospederos pone en alerta la fruticultura en el país, y puede conducir, por ejemplo, a procesos de diversificación lo cual puede llevar a la formación de razas de hospederos, nuevos taxa o complejos de especies. Un número limitado de estudios se han enfocado en entender el efecto que tienen las plantas hospederas en las poblaciones de especies del género Anastrepha. Para contribuir con información que permita responder esta pregunta, nosotros usamos la técnica pooled RAD-seq para evaluar la diferenciación genómica y estructura poblacional de A. obliqua relacionada con tres plantas hospederas: ciruela (Spondias purpurea) y mango (Mangifera indica) de la familia Anacardiaceae, y carambolo (Averrhoa carambola) de la familia Oxalidaceae.Publicación Acceso abierto Bioerosión en los acantilados rocosos de la costa central del Pacífico colombiano.(2018-04-25) Cantera Kintz, Jaime Ricardo; Lazarus, Juan Felipe; Cuellar Reina, Luis Miguel; Romero González, Paula Andrea; Ocampo Gil, Yeimy AndreaLa bioerosión ha sido descrita como un importante proceso biológico-geológico, responsable de la pérdida de estabilidad geomorfológica, involucrando áreas ocupadas por asentamientos humanos costeros en la costa pacífica colombiana. El presente proyecto tuvo como objetivo general, describir las principales características geológicas y biológicas de los acantilados afectados por la bioerosión, estimar la tasa de bioerosión en los acantilados, y relacionar esta tasa con el efecto que pueden ejercer las diferentes condiciones ambientales como el oleaje, las mareas y la dureza de las rocas en la costa central del Pacífico colombiano. El estudio sobre la abundancia y patrones de distribución de los organismos erosionadores utilizando cuadrantes de 0.0225 m2 para especies que realizan abrasión y bloques de 0.003375 m3 para organismos perforadores se permitió aumentar la lista de organismos participantes en el proceso de 43 a 73 especies y establecer las especies más abundantes y los lugares con mayor densidad de individuos. Los lugares con mayores abundancias de bioerosionadores endolíticos fueron Piangüita, Despensa y la estación de exposición media al oleaje de Juanchaco (Juanchaco M). La zona intermareal baja tuvo mayor abundancia de individuos y de especies que las otras zonas. El volumen de remoción más alto es de cerca de 1500 mm3/mes, por parte de la especie Pholadidea tubifera. Las tasas de bioerosión más altas fueron en la Despensa (entre 4,7 y 18,1 mm3/mes) y en Juanchaco M (entre 5,1 y 75,3 mm3/mes). El volumen removido por L. mesoleuca fue en promedio (±D.S.) por proceso de ramoneo 1,58 g/año/ind. (±2,34); mientras que un individuo de S. maura erosiona 1,66 g/año (±2,41) y uno de F. virescens erosiona 0,71 g/año (±0,03). La destrucción de acantilados medida por las varillas fue mínimas. El mayor valor fue en la Localidad de Cangrejal, donde una varilla de la zona intermareal media, presentó la mayor pérdida de roca 2,5 cm. Las imágenes examinadas mostraron que la bioerosion de acantilados es un proceso importante porque modifica la costa en zonas de acantilados en cerca de 10 metros en 42 años, pero es menos fuerte que la pérdida de costa en playas arenosas donde en el mismo periodo se perdieron en algunos lugares hasta 88 metros. El presente estudio permitió estimar la tasa de bioerosión de la costa rocosa en el Pacífico central colombiano, logrando identificar las localidades vulnerables a la bioerosión y a la pérdida de la línea de costa, lo cual es una información muy importante para la planeación de la ocupación de estas áreas con desarrollos urbanos o turísticos. Estos resultados permiten implementar acciones de mitigación y/o prevención.Publicación Acceso abierto Conectividad genética de poblaciones naturales de la piangua (Anadara tuberculosa y Anadara similis) en la costa Pacífica colombiana estimada a partir de marcadores moleculares microsatélites.(2018-04-23) Cantera Kintz, Jaime Ricardo; Cárdenas, Heiber; Fuentes, Ángela; González, Fanny; Quesada, Suany; Gil, Julián; Gallo, JennyAnadara tuberculosa y Anadara similis, especies conocidas bajo el nombre común “piangua”, son bivalvos marinos que habitan las áreas de manglar, generalmente cerca de las raíces del mangle rojo. Presentan un ciclo de vida dual, con una etapa adulta bentónica y una etapa larval pelágica. Estos bivalvos soportan la principal pesquería artesanal de moluscos en la costa Pacífica Americana desde Baja California hasta Perú. En Colombia la extracción de A. tuberculosa se ha incrementado en los últimos años debido a la alta demanda por parte de Ecuador. Esto ha ocasionado una explotación descontrolada del recurso y una disminución de las poblaciones naturales, lo que ha llevado a que estas especies sean catalogadas en amenaza. Para avanzar en el desarrollo de estrategias de uso sostenible de la piangua es importante estimar el grado de conectividad existente entre poblaciones, de manera que se puedan dirigir los esfuerzos de conservación. Una de las estrategias más utilizadas para estimar dicha conectividad es estudiar la genética de poblaciones de estos organismos usando marcadores moleculares. En esta investigación se analizaron 152 individuos de A. tuberculosa provenientes de 9 localidades distribuidas a lo largo de la costa Pacífica colombiana con base en la variación alélica de 8 loci microsatélites, los cuales fueron identificados y caracterizados por primera vez para la especie en este estudio. Todos los loci son polimórficos, con un número de alelos (Na) entre 10 (AT07) y 62 (AT01). El número efectivo de alelos fue de 3,4 (AT07) a 29,87 (AT01). La heterocigosidad media observada (HO) fue de 0,289 (AT05) a 0,742 (AT14), mientras que la heterocigosidad media esperada (HE) fue de 0,589 (AT13) a 0,97 (AT01). La mayoría de los loci analizados mostraron desviaciones significativas del equilibrio de Hardy-Weinberg (5/8) lo cual puede ser producto de la presencia de alelos nulos. Sin embargo, se ajustan significativamente al modelo de máxima varianza (frecuencia alélica igual al inverso del número de alelos por marcador). Todos los estimadores de diferenciación genética global calculados, incluyendo los corregidos para alelos nulos con el método ENA, mostraron valores similares cercanos o iguales a cero indicando ausencia de estructura genética poblacional (FST= 0.0012, G´ST= 0.0068, Djost= 0, FST (con ENA)= -0,001051, y FST (No ENA)= -0,003052). Lo mismo se obtuvo en los estimadores de diferenciación genética por parejas de poblaciones. El análisis jerárquico de estructura poblacional AMOVA tampoco indico estructura significativa para el FST (0,002; P=0,071). El programa STRUCTURE indicó que el número más probable de poblaciones en las muestras analizadas es K=1. Estos resultados indican que las poblaciones naturales de A. tuberculosa estudiadas no muestran estructura genética significativa, de lo cual se infiere que se comportan como una sola población genética panmictica en la región de la costa Pacífica de Colombia. Las características biológicas de la especie sumadas a las condiciones oceanográficas de la región permiten inferir que esta especie tiene un alto potencial dispersivo en su estado larval abarcando los cerca de 1700 Km de costa en el Pacífico de Colombia lo cual es soportado por los datos genéticos obtenidos.Publicación Acceso abierto Coralivora (Jenneria pustulata) y bioerosión (Diadema mexicanum) en los arrecifes de La Azufrada y Playa Blanca (Isla Gorgona), Pacífico colombiano.(2018-05-02) Londoño-Cruz, Edgardo; Donovan Obonaga, Levy; Zucconi, Mauro GiovanniLos arrecifes coralinos son ecosistemas muy importantes y altamente biodiversos; y son, como todos los ecosistemas, afectados por diversos procesos, entre ellos están los de índole biológico como la coralivoría y la bioerosión. La coralivoría es el consumo directo de tejido coralino por parte de un depredador; por su parte, la bioerosión es la remoción de sustrato por parte de un organismo. El conocimiento del efecto de estos dos procesos sobre los arrecifes del Pacífico colombiano es escaso; es por esto que el objetivo de la presente investigación fue determinar la densidad y tasa de bioerosión por parte de Diadema mexicanum en el arrecife La Azufrada y cuantificar la abundancia y tasa de coralivoría del gasterópodo Jenneria pustulata en los arrecifes La Azufrada y Playa Blanca (Gorgona, Colombia). Para determinar la abundancia de D. mexicanum se utilizaron cuadrantes ( ); y para la talla, todos los individuos dentro de los cuadrantes fueron medidos (alto y ancho de la testa). En cada zona se capturaron 30 individuos, registrando la profundidad de captura y se fijaron en formalina al 10% para, posteriormente, determinar el consumo de carbonato de calcio y finalmente la tasa de bioerosión. En el caso de los caracoles J. pustulata, considerando su estilo de vida, fueron buscados activamente bajo colonias coralinas. Los individuos colectados fueron medidos para determinar la estructura de tallas para cada arrecife. Por otro lado, se realizó una fase de laboratorio en la cual se midió el consumo de tejido coralino de J. pustulata durante 24h, para ambos arrecifes. Los resultados mostraron que la densidad y talla ( ̅ ) de D. mexicanum fueron de ⁄ y respectivamente y que la tasa de bioerosión total para el arrecife fue de ⁄⁄. La talla mostró una relación positiva y significativa (P=2.2×10-16) sobre la tasa de bioerosión. Por su parte, se encontraron 72 y 128 individuos de J. pustulata en La Azufrada y Playa Blanca respectivamente; la talla promedio de estos caracoles fue de y en La Azufrada y Playa Blanca respectivamente. Aunque las tallas fueron significativamente diferentes (P=0,0001) entre los arrecifes; no hubo diferencias en el consumo de tejido coralino. Aunque tanto las tasas de coralivoría (Jenneria pustulata) como de bioerosión (Diadema mexicanum) se encuentran dentro de los valores reportados por diferentes autores, se sugiere continuar con los estudios con el ánimo de conocer las dinámicas de estos organismos y entender cómo estas afectan los procesos de coralivoría y bioerosión en los arrecifes de la Isla Gorgona.Publicación Acceso abierto Detección del virus Epstein Barr (VEB) en escolares adolescentes en la ciudad de Cali- Colombia.(Universidad del Valle, 2019) Castillo Giraldo, Andres Orlando; Ocampo, Sebastián; Fernández, Adrián; Osorio, Julio Cesar; Grupo Génetica Molecular HumanaLa principal ruta de transmisión del virus Epstein Barr (VEB) es vía oral, a través de la saliva, en la cavidad oral el virus infecta y se replica en las células epiteliales adyacentes al anillo de Waldeyer; en donde, seguidamente, infecta los linfocitos B. Aproximadamente el 80% de los casos de mononucleosis aguda infecciosa (MI) ocurre en la adolescencia y es causado por VEB. La MI se caracteriza por cursar con fiebre, garganta irritada y glándulas linfáticas inflamadas. El virus Epstein Barr (VEB) está clasificado como carcinógeno del grupo 1 por la Agencia Internacional para la Investigación del Cáncer (IARC). La infección del EBV se ha relacionado con una amplia variedad de enfermedades, desordenes linfoproliferativos postransplantes, linfomas de células B y T, carcinoma nasofaríngeo, sarcoma del musculo liso, cáncer gástrico, leucoplasia vellosa oral, linfoma de Burkitt y el linfoma de Hodking. El presente trabajo de investigación pretende determinar la frecuencia de exposición al VEB en cavidad oral y determinar los factores asociados a su presencia en estudiantes de colegios de secundaria en la ciudad de Cali-Colombia.Publicación Acceso abierto Determinación de la relación génica entre el gen 5S rADN tipo I y tipo II entre peces óseos y cartilaginosos.(2018-05-02) González Obando, Ranulfo; Cárdenas Henao, Heiber; Hleap Lozano, José Sergio; Castro Piedrahita, Sergio IvánDeterminar la ortología y paralogía entre genes es un requisito para entender su historia evolutiva y validar las relaciones fiogenéticas. El ADNr 5S es un marcador molecular usado para identificar especies, subespecies, poblaciones, cepas e híbridos y elaborar análisis filogenéticos.Publicación Acceso abierto Dinámica de la emisión de gases de efecto invernadero en un ecosistema acuático eutrofizado (laguna de Sonso).(2018-08-27) Peña Salamanca, Enrique Javier; Silva, Juan PabloLos humedales naturales son ecosistemas estratégicos que ofrecen servicios ambientales tales como la prevención de inundaciones, el secuestro de carbono, la filtración de nutrientes y el mantenimiento de la biodiversidad, entre otros. El problema de estos ecosistemas alrededor del mundo, es que han sido fuertemente impactados debido a las actividades antrópicas relacionadas con la agricultura y ganadería, la descarga de excesos de fertilizantes de los sistemas agrícolas, la urbanización y el vertimiento de aguas residuales provenientes de asentamientos humanos. El estudio se realizó en la Laguna de Sonso ubicada en el sur occidente de Colombia, en la margen derecha del Río Cauca a 937 msnm entre los municipios de Buga, Yotoco y Guácari.Publicación Acceso abierto Diversidad genética de peces del Santuario de Fauna y Flora Malpelo, con énfasis en las especies endémicas.(Universidad del Valle, 2019-06-12) Tavera, Jose; Rojas Vélez, Stephania; Grupo de investigación Ecología de Arrecifes Coralinos; Sistemática, Evolución y Biogeografía Animal (SEyBA)Las especies endémicas son especialmente vulnerables a las perturbaciones y se sitúan en mayor riesgo de extirpación local que las especies con distribuciones más extendidas. Esto es debido a factores (evolutivos, oceanográficos, biológicos, ecológicos y genéticos) que operan a diferentes escalas espacio/temporales, conviertendo a estas especies en una oportunidad única para estudiar y comprender el origen o mantenimiento de la vida en el planeta. El presente trabajo analizó el estado de la diversidad genética de los peces endémicos (Axoclinus rubinoffi, Acanthemblemaria stephensi, Halichoeres malpelo y Chriolepis lepidota) del Santuario de Fauna y Flora Isla Malpelo. Se colectaron alrededor de la isla, un total de 30 individuos por cada una de las especies, para realizar la amplificación de la región mitocondrial control (D-loop). Posteriormente, se calculó el número de haplotipos (Hn), la diversidad haplotípica (Hd) y la diversidad nucleotídica (π). Se realizaron redes de haplotipos y se compararon los indicadores de diversidad genética con especies estrechamente relacionadas. La especie que presentó mayor diversidad haplotípica fue H. malpelo, seguida por A. rubinoffi, A. stephensi y en último lugar, C. lepidota. Todas las especies endémicas presentaron valores de diversidad haplotípica y nucleotídica menores con respecto a especies cercanas que han sido evaluadas en otras investigaciones, usando la región control mitocondrial. Esto puede deberse a tamaños efectivos reducidos, o a rasgos en la historia de vida que limitan la capacidad de dispersión, dos factores que influyen considerablemente en los niveles de diversidad genética de las especies.Publicación Acceso abierto Efecto de la formación de exopolisacáridos por bacterias ácido lácticas sobre las propiedades reológicas de masas de harina de quinua.(2018-04-23) Bolívar, Germán; Ramírez, Cristina; Bolívar Monsalve, Edna Johana; Ceballos González, Carlos Fernando; Betancourt Gordillo, Diana MarcelaEstudios recientes han demostrado una demanda en aumento de productos alimenticios libre de gluten a nivel mundial, pues se ha descubierto que la enfermedad cilíaca (intolerancia al gluten) es uno de los trastornos más frecuentes en todo el mundo, afectando el 0.5-1% de la población. Sin embargo, la calidad sensorial de los productos libres de gluten es muy baja, debido a la ausencia de las propiedades viscoelásticas que le confiere el gluten a los productos, en especial a los de panificación.Publicación Acceso abierto Estado poblacional de las tortugas continentales en la región costera del Valle del Cauca.(2018-04-23) Giraldo, Alan; Garcés Restrepo, Mario FernandoLa situación de conservación de las tortugas continentales (terrestres y dulceacuícolas) nivel mundial es preocupante. Por lo menos el 39% de las especies registradas se encuentra catalogado en alguna de las categorías de conservación, por lo que se requiere enfocar esfuerzos de investigación hacia estas poblaciones. La zona neotropical es la zona de mayor diversidad de tortugas del mundo, y en esta región la provincia biogeográfico de choco biogeográfico ha sido identificada como uno de los reductos de biodiversidad biológica a nivel del planeta. En esta provincia, son diferentes los factores que amenazan la viabilidad poblacional de las tortugas, entre otros se destacan dos elementos fundamentales el desconocimiento básico de su biología y ecología y el efecto humano sobre las poblaciones a escala local. En la costa pacífica del Valle del Cauca, sin embargo siguen siendo las poblaciones humanas la problemática que acaece en mayor grado sobre las tortugas, el crecimiento demográfico de las poblaciones y el auge del turismo han acelerado los procesos de degradación de los hábitats por la necesidad creciente de maderas y terrenos para la construcción, y han aumentado la explotación de tortugas por consumo de las poblaciones y trafico como mascotas. Adicionándose a esta problemática el desconocimiento total del estado poblacional de las tortugas continentales y grandes vacíos en la información de su ecología y biología proyectan un panorama desolador. En esta región encontramos cinco especies de tortugas continentales tres de ellas del genero Rhinoclemmys: R. nasuta, R. melanosterna y R. annulata; Chryptochelys leucostoma y la tortuga mordedora Chelydra acutirostris. Dentro de estas especies R. annulata y R. nasuta son catalogadas como casi amenazadas (NT) por la IUCN, esta última adicionalmente se considera casi endémica. A nivel nacional R. melanosterna es clasificada como casi amenazada (NT), R. annulata y R. nasuta se consideran en la categoría de datos deficientes. Pese a que las otras dos especies no se encuentran en ninguna categoría de amenaza, las dos son traficadas activamente como mascotas y utilizadas como fuentes alternativas de proteína. Debido a la vulnerabilidad de estas especies y al desconocimiento general del estado de sus poblaciones naturales, este proyectoestimó las densidades poblacionales de estas especies, siendo correlacionadas con las variables ambientales, para evaluar cómo estas afectan las poblaciones de tortugas. De igual manera y teniendo en cuenta el efecto antrópico generado por humanos se evaluó si existe una correlación entre el estado poblacional de estas especies con los niveles de presión antrópica.Publicación Acceso abierto Estructura del paisaje como modelador del flujo génico de dos especies de hormigas cazadoras en la zona cafetera de los Andes.(Universidad del Valle, 2019-02-16) Armbrecht, Inge; Fong, Cristian; Herrera Rangel, Janine; Grupo de investigación en Ecología de Agroecosistemas y Hábitats Naturales – GEAHNALa reducción antropogénica de las áreas boscosas es una de las principales causas de pérdida de diversidad biológica y su resultado se refleja en la conformación de los paisajes rurales, en donde los fragmentos de bosque quedan embebidos en diversos hábitats antropogénicos. Este panorama es típico en los Andes Colombianos, que presenta un 70% de pérdida de hábitat. Para formular estrategias futuras de conservación mejorando la conectividad de la matriz agrícola se planteó este estudio para determinar cómo el hábitat transformado típico de un paisaje rural afecta la estructura genética de dos especies de hormigas cazadoras (Gnamptogeys bisulca, propia de bosques y Ectatomma ruidum, propia de zonas abiertas) de los Andes Colombianos, y cómo éstas responden, dependiendo de su preferencia al hábitat, biología e historia natural. Se colectaron las dos especies en áreas rurales del municipio de La Celia (Risaralda). Se hizo un análisis poblacional utilizando seis marcadores polimórficos para Gnamptogeys bisulca y 17 para Ectatomma ruidum. Se realizaron cálculos de Fsts y de distancia inter-individuos. Para Ectatomma ruidum se encontró que esta especie no presentó ningún grado de estructura genética, mientras que para Gnamptogeys bisulca se encontró la formación de dos clústers, lo cual demuestra la presencia de una estructura genética en la zona de estudio, no tanto relacionada con los accidentes geográficos. Los datos colectados aquí demuestran que las modificaciones del paisaje han disminuido la frecuencia de flujo génica entre los parches de bosque, hábitat de Gnamptogeys bisulca, mientras que esta misma fragmentación al parecer no afecta la movilidad de Ectatomma ruidum. Lo anterior conduce a deducir que la fragmentación del paisaje puede tener efectos diferenciales entre especies y que dependerán de su historia natural.Publicación Desconocido Evaluación de los patrones de riqueza y endemismo de la familia Araceae a nivel altitudinal y latitudinal.(2019-10-31) Zuluaga Trochez, Alejandro; Torres, Alba Marina; Llano, Martin; Guevara, Leonardo; Muñoz, AllisonEl norte de los Andes es una de las regiones con la mayor diversidad del mundo, y como muchas otras familias de angiospermas, la familia Araceae tiene su centro diversidad en esta región, especialmente en la vertiente pacífica de los Andes en Colombia, donde se han registrado hasta 100 especies en 0.9 hectáreas. Se estima que Colombia tiene más de 1000 especies de aráceas y se ha propuesto que esta alta diversidad de Aracearse se debe, entre otros factores, al alto endemismo que existe tanto a nivel altitudinal como latitudinal, como consecuencia de la diversidad topográfica de la región, pero no se han evaluado estos factores de manera conjunta para la familia, Con este trabajo se evaluó la riqueza y el endemismo para dos áreas del Chocó Biogeográfico separadas por 100 km, y con un gradiente altitudinal de 1000 m. En total se registraron 10 géneros y 230 especies y morfoespecies.Publicación Desconocido Formulación de un conjugado microbiano para el control biológico de colonias naturales de hormiga arriera, Atta cephalotes (Hymenoptera : Myrmicinae).(2018-05-02) Montoya Lerma, James; Armbrecht, Inge; Castaño, Karen; Rodríguez, Jonathan; Giraldo, Carolina; Valencia Giraldo, Sandra; Mina Mejía, Sayra; Sandoval, StephaniaLa hormiga cortadora de hojas, Atta cephalotes, causa cuantiosas pérdidas económicas al defoliar parcial o totalmente plantas ornamentales, cultivadas o de importancia forestal y se relaciona además con la afectación de las áreas urbanas que, en ciudades como Cali, suele estar asociada con la inestabilidad en terrenos, muros de contención y subsidencia en viviendas y construcciones. Su avanzada organización social, capacidad de adaptación y relaciones simbióticas con microorganismos les confieren resistencia y protección, lo cual ha hecho difícil encontrar estrategias de control que permitan regular sus poblaciones de manera eficiente. Estudios sistemáticos, llevados a lo largo de una década, entre Univalle y CIPAV han permitido identificar una serie de microorganismos antagonistas y entomopatógenos con potencial de alterar las relaciones simbióticas al interior de las colonias. Sin embargo, estas evaluaciones se han hecho exclusivamente en condiciones de laboratorio y se identifica la necesidad de evaluar su efectividad sobre nidos naturales. Por esta razón, se planteó la presente investigación con el objetivo de producir y evaluar un formulado microbiano dirigido a atacar las colonias de hormiga arriera en dos frentes: i) afectación de las obreras a partir del uso de entomopatógenos y, ii) alteración del desarrollo del hongo simbionte y demás microorganismos asociados, por acción de agentes antagónicos (bacterias y hongos previamente identificados). Inicialmente se evaluó la capacidad de coexistencia de los microorganismos con potencial para controlar A. cephalotes con el fin de definir los microorganismos que harían parte de la formulación.Publicación Desconocido Frecuencias de infección y filogenia de simbiontes bacterianos en poblaciones de Atta cephalotes de Colombia.(Universidad del Valle, 2019-04-08) Montoya Lerma, James; Niño, Andrea Cecilia; Armbrecht, Inge; Correa Bueno, Odair; Muñoz Valencia, Vanessa; Valencia Giraldo, Sandra Milena; López Peña, Andrea; Vélez M., Glever Alexander; Mina, Sayra Yadi; Grupo de investigación en Ecología de Agroecosistemas y Hábitats Naturales.La hormiga arriera Atta cephalotes es el principal herbívoro del Neotrópico y es considerada un organismo plaga por las pérdidas económicas que genera en sistemas de cultivo y en centros urbanos. Aunque se emplean diversos métodos en su control, la complejidad de esta especie hace que se presenten barreras biológicas y comportamentales, que limitan su efectividad. En Colombia se ha avanzado en el conocimiento de la biología de la hormiga arriera y se han encontrado diferentes microorganismos ectosimbiontes asociados a las hormigas, que aún no han sido caracterizados. Al parecer estos microorganismos establecen relaciones simbióticas que protegen a las hormigas de agentes biológicos con capacidad antagónica o entomopatógena. Sin embargo, no se ha explorado la presencia de otros simbiontes como los endosimbiontes secundarios, algunos de los cuales pueden comportarse como patógenos a nivel reproductivo en diferentes órdenes de insectos. Este estudió contribuyó con la evaluación de la distribución, frecuencias de infección y filogenia de los endosimbiontes Wolbachia, Rickettsia, Spiroplasma, Cardinium y Arsenophonus y de los ectosimbiontes Serratia marcescens y actinobacterias en poblaciones colombianas de A. cephalotes. Los resultados indican que no hay evidencia de asociación entre A. cephalotes y bacterias del grupo actinobacterias. Esto sugiere la presencia de otras bacterias ectosimbiontes en A. cephalotes que pueden funcionar como equivalentes ecológicos a las actinobacterias. En este sentido, la alta frecuencia de infección por Serratia marcescens y su actividad antagónica sobre cepas usadas comercialmente para el control de este insecto plaga soportan esta hipótesis. Además, el ectosimbionte S. marcescens se reportó asociado a las obreras con labores al interior del nido.Publicación Desconocido Obtención de ADN arqueológico y su validación para el estudio comparativo de la diversidad genética de poblaciones prehispánicas y amerindias actuales del Sur-Occidente colombiano.(2018-05-02) Barreto Rodríguez, Guillermo; Rodríguez, Carlos ArmandoLa obtención de ADN arqueológico (ADNa), correspondiente a poblaciones prehispánicas colombianas, ha venido creciendo en importancia debido a los datos que puede aportar para resolver preguntas sobre el origen de las poblaciones ancestrales, su relación biológica con las poblaciones actuales, la presencia de enfermedades y los patrones de migración. Con el fin de obtener ADN útil para estudios de antropología molecular con el desarrollo de este trabajo se implementó una metodología de extracción de ADNa la cual es sensible a bajas concentraciones de ADNa, reproducible y relativamente de bajo costo. Con esta metodología se extrajo ADNa a partir de restos óseos de 23 individuos excavados en tumbas prehispánicas contextualizadas biológica y culturalmente con filiación cultural Quimbaya Tardío (13) y Sonso (10) (460 -1510 años antes del presente) del Cauca Medio. Las concentraciones de ADNa extraído en 21 de las 23 muestras variaron entre 60 y 30000 pg/ μl. La calidad del ADNa extraído se evaluó por su eficiencia en la amplificación por la PCR de las regiones del ADN mitocondrial que caracterizan los cuatro principales haplotipos amerindios (A, B, C, D), un fragmento de la región hipervarible y un fragmento del gen de la amelogenina que permite determinar el sexo de cada resto óseo. Se tipificaron exitosamente los haplotipos de ADNmt en 12 de los 23 individuos de la muestra, con frecuencias A=0 B=0,83, C=0,17, D=0 para Obando y A=0,17 B=0,68, C=0,17, D=0 para Guacandá. De las muestras recientes se secuenció la región hipervariable I de 97 individuos del Suroriente colombiano y se incluyeron datos de comunidades andinas previamente reportados. La comparación de los datos obtenidos en el presente trabajo con datos de poblaciones antiguas y poblaciones recientes del Suroriente y Suroccidente colombiano mostró que las muestras de Obando y Guacandá son más cercanas a las poblaciones andinas que a las poblaciones amazónicas. Este proyecto pionero en el Suroccidente colombiano, constituye en consecuencia, un primer esfuerzo interdisciplinario para la realización de estudios de arqueología molecular en el Norte de Suramérica.Publicación Desconocido Patrones de diversificación morfológica y funcional de peces marinos, expuestos a condiciones ambientales contrastantes. Pacífico oriental versus Caribe.(2019-10-31) Tavera Vargas, Jose Julian; Wainwright, PeterEl levantamiento del istmo de Panamá fue un prolongado y complejo proceso geológico ocurrido durante los últimos 15 millones de años (Ma), que dejó consecuencias evidentes en la circulación global, patrones climáticos, biogeografía, ecología y evolución tanto de la fauna terrestre como de la marina (Stehli & Webb, 1985). La notable similitud morfológica hallada en un elevado número de pares de especies de peces, una a cada lado del continente americano, llevó a (Jordan, 1908), a enlistarlas e hipótetizar acerca de la estrecha afinidad existente entre ellas. Dos ideas principales extraídas del trabajo de Jordan constituyen la base para la hipótesis de esta propuesta. 1) El ancestro común de las especies separadas por el istmo vivía esencialmente bajo las mismas condiciones desde finales del Mioceno hasta el levantamiento total de esta barrera. 2)“una vez separadas las especies estas se modifican en una dirección continua inducida por la selección en el medio ambiente local”. En esta frase Jordán reconoce que las condiciones ambientales pueden dirigir el cambio morfológico. Por lo tanto, el objetivo general de este trabajo radica en comparar la tasa de evolución morfológica de algunos pares de especies hermanas pertenecientes a diferentes familias de peces, con distintas historias de vida y que habitan a cada lado del istmo de Panamá. Para esto se debe reconstruir la historia evolutiva de algunas familias de peces marinos que se pudieron haber diversificado y especiado debido al levantamiento del istmo de Panamá. Identificar los pares de especies hermanas transístmicos y no transístmicos además de las poblaciones de especies circumtropicales. Calibrar el tiempo de divergencia de todos los eventos de especiación atribuibles al istmo panameño. Calcular la tasa de evolución morfológica usando la geografía (i.e Pacífico oriental versus Caribe) como descriptor, y finalmente determinar si existen patrones de convergencia detectables entre los diferentes taxa de cada lado de la barrera que puedan asociarse con características ambientales.Publicación Desconocido Variación espacial y temporal de las comunidades de parásitos metazoarios de Carangoides caballus (günther, 1868) en el norte del pacífico colombiano.(2018-05-02) Giraldo López, Alan; Cordoba, Diego; Ramírez, Gustavo; Moreno, Melissa; Calle, Isabel CristinaEntender la estructura de la comunidad patrones y las variables ambientales que influyen en la composición, abundancia y diversidad de las comunidades de parásitos ha sido uno de los más importantes retos para la ecología de parásitos. Sin embargo, los estudios en comunidades de parásitos han mostrado que la estructura de la comunidad cambia en el tiempo y en espacio. . El conocimiento de los parásitos, su biología y su ecología permite ampliar paralelamente el conocimiento sobre sus hospederos, su impacto sobre ellos, ya sea en la modelación de sus poblaciones, en las consecuencias derivadas de su consumo o en las consecuencias que la perturbación ambiental pueda estar generando. En el pacífico colombiano existen comunidades que dependen de la pesca artesanal para su subsistencia, consumiendo especies de peces que pueden ser capturadas con métodos tradicionales y que se constituyen en la más importante fuente de proteína animal de dichas comunidades. Una de esta especies es la Burica (Caranx caballus) un pez de la zona costera que es objeto de pesca y que es apreciado por los pescadores. En el norte del Chocó se ha declarado una Zona Exclusiva de Pesca Artesanal para proteger los recursos pesqueros para los asentamientos humanos que tradicionalmente han derivado sus sustento de la pesca en esta zona del Pacífico colombiano. En esta zona se establecieron tres sitios de muestreo: uno en el sector de Punta Piñas, otro Tebada y otro frente a Bahía Solano, en caladeros tradicionales de pesca de los pescadores de la región, con el fin de obtener individuos de C. caballus capturados por pescadores de la zona, a estos peces se les realizó un análisis parasitológico con el objetivo de determinar la diversidad de parásitos que se hospedan en él, su estructura comunitaria y su posible variación temporal y espacial. Los parásitos se detectaron mediante inspección visual con la ayuda de equipos estereoscópicos. Se fijaron y se identificaron hasta el nivel taxonómico más bajo posible. Se establecieron los parámetros de infección y se caracterizó la comunidad de parásitos a nivel de infracomunidad, donde se estableció su ubicación dentro de los órganos parasitados, y la comunidad componente para cada zona. Los resultados obtenidos por temporada fueron comparados. También se hizo un análisis alimentario de los peces capturados con el fin de relacionar los ítems alimentarios con la presencia de los parásitos encontrados.